Mycobacterium phage NuevoMundo
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Detailed Information for Phage NuevoMundo
Discovery Information
Isolation HostMycobacterium smegmatis mc²155
Found ByIzamar Flores Castillo
Year Found2011
Location FoundDenton, TX USA
Finding InstitutionUniversity of North Texas
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?Yes
Isolation TemperatureNot entered
GPS Coordinates33.146508 N, 97.102889 W Map
Discovery NotesAcquired 1 to 2 inches below ground. Soil was dark and kind of moist. It was acquired at 7:30 in the morning. The temperature was around 31.67° Celsius.
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedFeb 9, 2012
Sequencing FacilityDavid H. Murdock Research Institute
Shotgun Sequencing Method454 Pyrosequencing
Approximate Shotgun Coverage227
Genome length (bp)155943
Character of genome endsCircularly Permuted
GC Content64.7%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterC
SubclusterC1
Cluster Life CycleLytic
Other Cluster Members

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Boonesok (None)

CLach (None)

DavidMina (None)

DitchDweller (None)

Elpis (None)

Genet (None)

Hard2get (None)

Hippocrates (None)

Kali (None)

LittleSpot (None)

Lsquared (None)

Marlex (None)

Minipoke (None)

PeeWee (None)

Pesky7 (None)

Phomnie (None)

Phyllis (None)

Roku (None)

Sagamore (None)

Samarai (None)

ShenziUR (None)

TinyC (None)

Trilla23 (None)

Turret (None)

Squidney (A3)

Ading (C1)

Adlitam (C1)

Alice (C1)

Amataga (C1)

ArcherS7 (C1)

Astraea (C1)

Atlantean (C1)

Atlas (C1)

Audrick (C1)

Ava3 (C1)

BadAgartude (C1)

Bangla1971 (C1)

Basquiat (C1)

BeanWater (C1)

Bigswole (C1)

Bipolarisk (C1)

Bonray (C1)

Bread (C1)

Breeniome (C1)

Burrough (C1)

Bxz1 (C1)

Cali (C1)

Cane17 (C1)

Catera (C1)

Chargie21 (C1)

CharlieB (C1)

ChickenPhender (C1)

Colt (C1)

Daffodil (C1)

Dandelion (C1)

Darko (C1)

Delilah (C1)

Derek (C1)

Dietrick (C1)

Doodle1 (C1)

Drazdys (C1)

DrPhinkDaddy (C1)

DTDevon (C1)

EmmaElysia (C1)

EmToTheThree (C1)

Erdmann (C1)

ErnieJ (C1)

Essence (C1)

ET08 (C1)

Ewok (C1)

Exxus285 (C1)

Flabslab (C1)

Fludd (C1)

FoxtrotP1 (C1)

FrayBell (C1)

FudgeTart (C1)

Gabriel (C1)

Ghost (C1)

Gizmo (C1)

HarrySpotter (C1)

HyRo (C1)

InigoMontoya (C1)

InterFolia (C1)

Iota (C1)

Isee1101 (C1)

JennanaJr (C1)

JustHall (C1)

Kamryn (C1)

Khaleesi (C1)

Koguma (C1)

LifeSavor (C1)

LinStu (C1)

Lionheart (C1)

Littleton (C1)

Loanshark (C1)

LRRHood (C1)

Lukilu (C1)

Lysocool (C1)

Megamind (C1)

Melpomini (C1)

MePac (C1)

MikeLiesIn (C1)

Momo (C1)

MoMoMixon (C1)

Morizzled23 (C1)

MrsHay (C1)

Naija (C1)

Napoleon13 (C1)

Nappy (C1)

Nicolasphaqe (C1)

Nidhogg (C1)

NoodleTree (C1)

Norm (C1)

NuevoMundo (C1)

OaklaforG (C1)

ParkTD (C1)

Patch (C1)

Patter (C1)

Phlegm (C1)

Phox (C1)

Phusco (C1)

Pier (C1)

Pio (C1)

Pivoine (C1)

Pleione (C1)

QBert (C1)

Rabinovish (C1)

Rahel (C1)

Rizal (C1)

RoMag (C1)

Roots515 (C1)

Salacia (C1)

SandySandal (C1)

Sauce (C1)

ScottMcG (C1)

Sebastian (C1)

Sebata (C1)

ShankPowerGod (C1)

Shaqnato (C1)

Shelob (C1)

ShiaLabeouf (C1)

Shnickers (C1)

Shrimp (C1)

SmallFry (C1)

Specks (C1)

Sprinklers (C1)

Spud (C1)

Stubby (C1)

Teardrop (C1)

TheO (C1)

Thuathua (C1)

TinyTim (C1)

Tonenili (C1)

Tortoise16 (C1)

Tyke (C1)

ValleyTerrace (C1)

Wally (C1)

Willis (C1)

Yucca (C1)

Zalkecks (C1)

Zeenon (C1)

ZygoTaiga (C1)

Matcha (C2)

Myrna (C2)

Phabba (C2)

SimSimmers (C2)

SrishMeg2525 (C2)

Annotation StatusIn GenBank
Plaque NotesThe size is fairly small, with a constant size of around .5 millimeters. The plaque is clear.
MorphotypeMyoviridae
Has been Phamerated?Yes
Gene List

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NuevoMundo_1

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(nucleotidyltransferase)

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(band-7 like membrane protein)

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(portal protein)

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(ThyX-like thymidylate synthase)

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(LysM domain protein)

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(major capsid protein)

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(tape measure protein)

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(minor tail protein)

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(baseplate J)

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(minor tail protein)

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NuevoMundo_162

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(peptidyl tRNA hydrolase)

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(beta-lactamase)

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(helicase)

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(aminotransferase)

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NuevoMundo_204

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(DnaC-like helicase loader)

NuevoMundo_206
(helicase)

NuevoMundo_207
(DnaB-like helicase)

NuevoMundo_208
(DNA primase)

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(DnaJ-like chaperonin)

NuevoMundo_211

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(DNA polymerase III alpha subunit)

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(peptide release factor 1)

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(RecA-like resolvase)

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(RusA-like resolvase)

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(Ro-like RNA binding protein)

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(glycosyltransferase)

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NuevoMundo_244
(glycosyltransferase)

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NuevoMundo_246
(glycosyltransferase)

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NuevoMundo_251

NuevoMundo_252
(lysin A)

NuevoMundo_253
(holin)

NuevoMundo_254
(lysin B)

NuevoMundo_255
(terminase)

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NuevoMundo_257

NuevoMundo_258

NuevoMundo_259

NuevoMundo_260
(polynucleotide kinase)

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NuevoMundo_262

NuevoMundo_263
(serine/threonine kinase)

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Publication Info
Uploaded to GenBank?Yes
GenBank AccessionMG812493
Refseq NumberNone yet
Published in PaperPope, Bowman, Russell, et al 2015, eLIFE: Whole genome comparison of a large collection of mycobacteriophages reveals a continuum of phage genetic diversity
Archiving Info
Archiving status Archived
SEA Designator 2011UNTDnuevomundoIFC
Pitt Freezer Box# 29
Pitt Freezer Box Grid# 20
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