Mycobacterium phage Pio
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Detailed Information for Phage Pio
Discovery Information
Isolation HostMycobacterium smegmatis mc²155
Found ByH. Donis-Keller
Year Found2005
Location FoundCambridge, MA USA
Finding InstitutionOlin College of Engineering
ProgramPhage Hunters Integrating Research and Education
From enriched soil sample?Unknown
Isolation TemperatureNot entered
GPS Coordinates42.373891 N, 71.109352 W Map
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedSep 20, 2011
Sequencing FacilityPittsburgh Bacteriophage Institute
Shotgun Sequencing MethodSanger Sequencing
Approximate Shotgun Coverage8
Genome length (bp)156758
Character of genome endsCircularly Permuted
GC Content64.8%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterC
SubclusterC1
Other Cluster Members

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Boonesok (None)

CLach (None)

DavidMina (None)

DitchDweller (None)

Elpis (None)

Genet (None)

Hard2get (None)

Hippocrates (None)

Kali (None)

LittleSpot (None)

Lsquared (None)

Marlex (None)

Minipoke (None)

PeeWee (None)

Pesky7 (None)

Phomnie (None)

Phyllis (None)

Roku (None)

Sagamore (None)

Samarai (None)

ShenziUR (None)

TinyC (None)

Trilla23 (None)

Turret (None)

Squidney (A3)

Ading (C1)

Adlitam (C1)

Alice (C1)

ArcherS7 (C1)

Astraea (C1)

Atlantean (C1)

Atlas (C1)

Audrick (C1)

Ava3 (C1)

BadAgartude (C1)

Bangla1971 (C1)

BeanWater (C1)

Bigswole (C1)

Bipolarisk (C1)

Breeniome (C1)

Bxz1 (C1)

Cali (C1)

Catera (C1)

CharlieB (C1)

ChickenPhender (C1)

Colt (C1)

Daffodil (C1)

Dandelion (C1)

Delilah (C1)

Derek (C1)

Drazdys (C1)

DrPhinkDaddy (C1)

DTDevon (C1)

EmmaElysia (C1)

EmToTheThree (C1)

Erdmann (C1)

ErnieJ (C1)

Essence (C1)

ET08 (C1)

Ewok (C1)

Exxus285 (C1)

Flabslab (C1)

FoxtrotP1 (C1)

FrayBell (C1)

Gabriel (C1)

Ghost (C1)

Gizmo (C1)

HarrySpotter (C1)

HyRo (C1)

InterFolia (C1)

Iota (C1)

Isee1101 (C1)

JennanaJr (C1)

Khaleesi (C1)

Koguma (C1)

LifeSavor (C1)

LinStu (C1)

Littleton (C1)

Loanshark (C1)

LRRHood (C1)

Lukilu (C1)

Lysocool (C1)

Melpomini (C1)

MePac (C1)

MikeLiesIn (C1)

Momo (C1)

MoMoMixon (C1)

Morizzled23 (C1)

Napoleon13 (C1)

Nappy (C1)

Nicolasphaqe (C1)

Nidhogg (C1)

NoodleTree (C1)

Norm (C1)

NuevoMundo (C1)

ParkTD (C1)

Patch (C1)

Patter (C1)

Phox (C1)

Pier (C1)

Pio (C1)

Pleione (C1)

QBert (C1)

Rizal (C1)

Roots515 (C1)

SandySandal (C1)

ScottMcG (C1)

Sebastian (C1)

Sebata (C1)

ShankPowerGod (C1)

Shaqnato (C1)

ShiaLabeouf (C1)

Shnickers (C1)

Shrimp (C1)

SmallFry (C1)

Specks (C1)

Sprinklers (C1)

Spud (C1)

Stubby (C1)

Teardrop (C1)

TheO (C1)

Thuathua (C1)

TinyTim (C1)

Tonenili (C1)

Tortoise16 (C1)

Tyke (C1)

Wally (C1)

Willis (C1)

Yucca (C1)

Zeenon (C1)

ZygoTaiga (C1)

Matcha (C2)

Myrna (C2)

Phabba (C2)

SimSimmers (C2)

SrishMeg2525 (C2)

MorphotypeMyoviridae
Final annotation complete?Yes
Number of Genes238
Number of tRNAs35
Number of tmRNAs1
Has been Phamerated?Yes
Gene List

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Pio_1

Pio_2

Pio_3
(NrdC)

Pio_4

Pio_5

Pio_6

Pio_7

Pio_8

Pio_9

Pio_10

Pio_11

Pio_12

Pio_13

Pio_14

Pio_15

Pio_16

Pio_17

Pio_18

Pio_19

Pio_20

Pio_21

Pio_22

Pio_23

Pio_24

Pio_25

Pio_26

Pio_27

Pio_28

Pio_29

Pio_30

Pio_31

Pio_32
(Band-7 Protein)

Pio_33

Pio_34

Pio_35

Pio_36

Pio_37

Pio_38

Pio_39

Pio_40

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Pio_43

Pio_44

Pio_45

Pio_46

Pio_47

Pio_48

Pio_49

Pio_50

Pio_51

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Pio_53

Pio_54

Pio_55

Pio_56

Pio_57

Pio_58

Pio_59

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Pio_61

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Pio_63

Pio_64

Pio_65

Pio_66

Pio_67

Pio_68

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Pio_70

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Pio_72

Pio_73

Pio_74

Pio_75

Pio_76

Pio_77

Pio_78

Pio_79

Pio_80

Pio_81

Pio_82

Pio_83

Pio_84

Pio_85

Pio_86
(ParB-like)

Pio_92
(DNA Polymerase III Subunit)

Pio_93

Pio_94
(DNA Polymerase subunit/ Intein)

Pio_95

Pio_96

Pio_97
(ThyX)

Pio_98

Pio_99

Pio_100
(LysM Domain)

Pio_101

Pio_102

Pio_103

Pio_104

Pio_105

Pio_106

Pio_107

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Pio_125

Pio_126

Pio_127

Pio_128

Pio_129

Pio_130

Pio_131

Pio_132

Pio_133

Pio_134
(Tail Assembly Chaperone)

Pio_135
(Tail Assembly Chaperone)

Pio_136
(Tape Measure)

Pio_137

Pio_138

Pio_139

Pio_140

Pio_141

Pio_142

Pio_143

Pio_144
(Baseplate J)

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Pio_146

Pio_147

Pio_148

Pio_149

Pio_150

Pio_151

Pio_152

Pio_153

Pio_154

Pio_155

Pio_156

Pio_157

Pio_158

Pio_159

Pio_163

Pio_164
(Peptidyl-tRNA Hydrolase)

Pio_171

Pio_179

Pio_181
(D-ala-D-ala Carboxypeptidase - Graham has this written on the bxz1 map, but I m getting better hits to a beta-lactamase?)

Pio_182

Pio_195

Pio_196
(Helicase)

Pio_197

Pio_198

Pio_199

Pio_200

Pio_201

Pio_202

Pio_203

Pio_204

Pio_205

Pio_206
(ArgD)

Pio_207

Pio_208

Pio_209

Pio_210
(DnaC)

Pio_211
(DnaB-like Helicase)

Pio_212

Pio_213
(DNA Primase)

Pio_214

Pio_215
(J-Domain)

Pio_216

Pio_217
(Pol III Alpha)

Pio_218
(IF1)

Pio_219
(RecA)

Pio_220

Pio_221

Pio_222

Pio_223
(RusA)

Pio_224

Pio_225

Pio_226

Pio_227

Pio_228

Pio_229

Pio_230

Pio_233

Pio_234

Pio_235

Pio_236

Pio_237

Pio_238

Pio_239
(Ro)

Pio_240

Pio_241

Pio_242

Pio_243

Pio_244

Pio_245

Pio_246

Pio_247
(Glycosyltransferase)

Pio_248

Pio_249

Pio_250

Pio_251

Pio_252
(Glycosyltransferase)

Pio_253

Pio_254

Pio_255

Pio_256

Pio_257
(LysA)

Pio_258

Pio_259
(LysB)

Pio_260

Pio_261

Pio_262

Pio_263

Pio_264

Pio_265
(Pnk)

Pio_266

Pio_267

Pio_268
(Ser/Thr-kinase)

Pio_269

Pio_270

Pio_271
(PurA)

Pio_272

Pio_273

Pio_274

Publication Info
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GenBank AccessionJN699013
Refseq NumberNone yet
Published in PaperPope, Bowman, Russell, et al 2015, eLIFE
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