Mycobacterium phage Pleione
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Detailed Information for Phage Pleione
Discovery Information
Isolation HostMycobacterium smegmatis mc²155
Found ByGrace Kroner and Emily Lazowick
Year Found2010
Location FoundSt. Louis, MO USA
Finding InstitutionWashington University in St. Louis
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?Yes
Isolation TemperatureNot entered
GPS Coordinates38.643594 N, 90.298122 W Map
Discovery NotesAbout 1 cm. below surface; soil was moist; urban environment; no buildings; some foot traffic; no nearby roads; no cement; water at the bottom of the hill; trees surrounding the area; on a north facing slope; harvested by a decomposing tree; 24 degrees Celsius; harvested on 9/3/2010 at 4:57 pm.
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedFeb 24, 2011
Genome length (bp)155586
Character of genome endsCircularly Permuted
GC Content64.7%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterC
SubclusterC1
Other Cluster Members

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Boonesok (None)

CLach (None)

DavidMina (None)

DitchDweller (None)

Elpis (None)

Genet (None)

Hard2get (None)

Hippocrates (None)

Kali (None)

LittleSpot (None)

Lsquared (None)

Marlex (None)

Minipoke (None)

PeeWee (None)

Pesky7 (None)

Phomnie (None)

Phyllis (None)

Roku (None)

Sagamore (None)

Samarai (None)

ShenziUR (None)

TinyC (None)

Trilla23 (None)

Turret (None)

Squidney (A3)

Ading (C1)

Adlitam (C1)

Alice (C1)

ArcherS7 (C1)

Astraea (C1)

Atlantean (C1)

Atlas (C1)

Audrick (C1)

Ava3 (C1)

BadAgartude (C1)

Bangla1971 (C1)

BeanWater (C1)

Bigswole (C1)

Bipolarisk (C1)

Breeniome (C1)

Bxz1 (C1)

Cali (C1)

Catera (C1)

CharlieB (C1)

ChickenPhender (C1)

Colt (C1)

Daffodil (C1)

Dandelion (C1)

Delilah (C1)

Derek (C1)

Drazdys (C1)

DrPhinkDaddy (C1)

DTDevon (C1)

EmmaElysia (C1)

EmToTheThree (C1)

Erdmann (C1)

ErnieJ (C1)

Essence (C1)

ET08 (C1)

Ewok (C1)

Exxus285 (C1)

Flabslab (C1)

FoxtrotP1 (C1)

FrayBell (C1)

Gabriel (C1)

Ghost (C1)

Gizmo (C1)

HarrySpotter (C1)

HyRo (C1)

InterFolia (C1)

Iota (C1)

Isee1101 (C1)

JennanaJr (C1)

Khaleesi (C1)

Koguma (C1)

LifeSavor (C1)

LinStu (C1)

Littleton (C1)

Loanshark (C1)

LRRHood (C1)

Lukilu (C1)

Lysocool (C1)

Melpomini (C1)

MePac (C1)

MikeLiesIn (C1)

Momo (C1)

MoMoMixon (C1)

Morizzled23 (C1)

Napoleon13 (C1)

Nappy (C1)

Nicolasphaqe (C1)

Nidhogg (C1)

NoodleTree (C1)

Norm (C1)

NuevoMundo (C1)

ParkTD (C1)

Patch (C1)

Patter (C1)

Phox (C1)

Phusco (C1)

Pier (C1)

Pio (C1)

Pivoine (C1)

Pleione (C1)

QBert (C1)

Rizal (C1)

Roots515 (C1)

SandySandal (C1)

ScottMcG (C1)

Sebastian (C1)

Sebata (C1)

ShankPowerGod (C1)

Shaqnato (C1)

ShiaLabeouf (C1)

Shnickers (C1)

Shrimp (C1)

SmallFry (C1)

Specks (C1)

Sprinklers (C1)

Spud (C1)

Stubby (C1)

Teardrop (C1)

TheO (C1)

Thuathua (C1)

TinyTim (C1)

Tonenili (C1)

Tortoise16 (C1)

Tyke (C1)

Wally (C1)

Willis (C1)

Yucca (C1)

Zeenon (C1)

ZygoTaiga (C1)

Matcha (C2)

Myrna (C2)

Phabba (C2)

SimSimmers (C2)

SrishMeg2525 (C2)

Plaque NotesVery small plaques, usually smaller than 1mm in diameter; clear plaques; no variation.
MorphotypeMyoviridae
Final annotation complete?Yes
Number of Genes237
Number of tRNAs36
Has been Phamerated?Yes
Gene List

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Pleione_1

Pleione_2

Pleione_3
(NrdC-like)

Pleione_4

Pleione_5

Pleione_6

Pleione_7

Pleione_8

Pleione_9

Pleione_10

Pleione_11

Pleione_12

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Pleione_14

Pleione_15

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(Histidine Triad domain)

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Pleione_26

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Pleione_29

Pleione_30

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(Band-7)

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Pleione_52

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Pleione_60

Pleione_61

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Pleione_64

Pleione_65
(HTH DNA binding domain)

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Pleione_74

Pleione_75

Pleione_76

Pleione_77

Pleione_78

Pleione_79

Pleione_80

Pleione_81

Pleione_82

Pleione_83

Pleione_84

Pleione_85
(ParB-like)

Pleione_91

Pleione_92

Pleione_93
(portal)

Pleione_94

Pleione_95

Pleione_96
(ThyX-like)

Pleione_97

Pleione_98
(Phosphoesterase)

Pleione_99
(LysM domain)

Pleione_100

Pleione_101

Pleione_102
(Major capsid)

Pleione_103
(zinc-finger domain, DNA binding)

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Pleione_126

Pleione_127

Pleione_128

Pleione_129

Pleione_130

Pleione_131

Pleione_132

Pleione_133
(tail assembly chaperone)

Pleione_134
(tail assembly chaperone)

Pleione_135
(tapemeasure)

Pleione_136

Pleione_137

Pleione_138

Pleione_139
(minor tail subunit)

Pleione_140

Pleione_141
(minor tail subunit)

Pleione_142

Pleione_143
(baseplate J)

Pleione_144
(HNH endonuclease domain)

Pleione_145

Pleione_146

Pleione_147

Pleione_148

Pleione_149

Pleione_150

Pleione_151

Pleione_152

Pleione_153

Pleione_154

Pleione_155

Pleione_159

Pleione_160
(Peptidyl-tRNA hydrolase domain)

Pleione_174
(Endonuclease VII)

Pleione_176
(D-alanyl D-alanine carboxypeptidase)

Pleione_177

Pleione_190

Pleione_191

Pleione_192
(helicase)

Pleione_193

Pleione_194

Pleione_195

Pleione_196

Pleione_197

Pleione_198

Pleione_199

Pleione_200

Pleione_201

Pleione_202

Pleione_203

Pleione_204

Pleione_205

Pleione_206
(DnaC-like)

Pleione_207
(DnaB-like helicase)

Pleione_208

Pleione_209
(DNA primase)

Pleione_210

Pleione_211
(DnaJ-like domain)

Pleione_212

Pleione_213
(Pol III alpha subunit)

Pleione_214
(RF1)

Pleione_215
(RecA)

Pleione_216

Pleione_217

Pleione_218
(HNH endonuclease domain)

Pleione_219
(Endodeoxyribonuclease RusA-like)

Pleione_220

Pleione_221

Pleione_222

Pleione_223

Pleione_224

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Pleione_229

Pleione_230

Pleione_231

Pleione_232

Pleione_233

Pleione_234

Pleione_235

Pleione_236

Pleione_237
(Ro)

Pleione_238

Pleione_239

Pleione_240

Pleione_241

Pleione_242

Pleione_243

Pleione_244
(Glycosyl transferase)

Pleione_245

Pleione_246
(Glycosyltransferase)

Pleione_247
(Galactosyl Transferase)

Pleione_248

Pleione_249
(Glycosyltransferase)

Pleione_250

Pleione_251

Pleione_252

Pleione_253

Pleione_254
(Lysin A)

Pleione_255
(holin)

Pleione_256
(Lysin B)

Pleione_257
(terminase)

Pleione_258

Pleione_259

Pleione_260

Pleione_261

Pleione_262
(Polynucleotide Kinase)

Pleione_263

Pleione_264

Pleione_265
(Serine-Threonine Kinase)

Pleione_266

Pleione_267

Pleione_268
(PurA)

Pleione_269

Pleione_270

Pleione_271

Pleione_272

Publication Info
Uploaded to GenBank?Yes
GenBank AccessionJN624850
Refseq NumberNC_023737
Published in PaperPope, Bowman, Russell, et al 2015, eLIFE
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