Mycobacterium phage Redno2
Know something about this phage that we don't? Modify its data.
Detailed Information for Phage Redno2
Discovery Information
Isolation HostMycobacterium smegmatis mc²155
Found ByAzhar Bashir
Year Found2011
Location FoundRichmond, VA USA
Finding InstitutionVirginia Commonwealth University
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?No
Isolation TemperatureNot entered
GPS Coordinates37.555833 N, 77.643611 W Map
Discovery NotesNear garden tomato plant by James River in Richmond, VA
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedFeb 21, 2012
Sequencing FacilityVirginia Commonwealth University Nucleic Acids Research Facilities
Shotgun Sequencing Method454 Pyrosequencing
Approximate Shotgun Coverage114
Genome length (bp)108297
Character of genome ends3' Sticky Overhang
Overhang Length4 bases
Overhang SequenceATCC
GC Content60.9%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterJ
Subcluster--
Cluster Life CycleTemperate
Other Cluster Members
Annotating InstitutionUnknown or unassigned
Annotation StatusIn GenBank
Plaque Notes1 mm, clear
MorphotypeSiphoviridae
Has been Phamerated?Yes
Gene List

Click to View

Redno2_1
(terminase small subunit)

Redno2_2

Redno2_3

Redno2_4

Redno2_5

Redno2_6

Redno2_7

Redno2_8

Redno2_9
(terminase large subunit)

Redno2_10

Redno2_11
(portal protein)

Redno2_12
(capsid maturation protease)

Redno2_13
(major capsid protein)

Redno2_14

Redno2_15
(ser/thr kinase)

Redno2_16
(methyltransferase)

Redno2_17
(glycosyltransferase)

Redno2_18
(glycosyltransferase)

Redno2_19
(glycosyltransferase)

Redno2_20

Redno2_21

Redno2_22
(glycosyltransferase)

Redno2_23

Redno2_24
(head-to-tail adaptor)

Redno2_25
(head-to-tail stopper)

Redno2_26

Redno2_27
(tail terminator)

Redno2_28

Redno2_29

Redno2_30
(major tail subunit)

Redno2_31
(tail assembly chaperone)

Redno2_32
(tail assembly chaperone)

Redno2_33
(tapemeasure protein)

Redno2_34
(minor tail protein)

Redno2_35
(minor tail protein)

Redno2_36
(minor tail protein)

Redno2_37
(minor tail protein)

Redno2_38
(D-ala-D-ala carboxypeptidase)

Redno2_39

Redno2_40

Redno2_41

Redno2_42

Redno2_43
(lysin A)

Redno2_44

Redno2_45
(lysin B)

Redno2_46
(holin)

Redno2_47

Redno2_48
(NrdH)

Redno2_49

Redno2_50

Redno2_51

Redno2_52

Redno2_53

Redno2_54

Redno2_55

Redno2_56
(LSR2 protein)

Redno2_57

Redno2_58

Redno2_59

Redno2_60

Redno2_61

Redno2_62

Redno2_63

Redno2_64

Redno2_65

Redno2_66

Redno2_67

Redno2_68

Redno2_69

Redno2_70

Redno2_71

Redno2_72

Redno2_73

Redno2_74

Redno2_75

Redno2_76

Redno2_77

Redno2_78
(integrase)

Redno2_79

Redno2_80

Redno2_81

Redno2_82

Redno2_83

Redno2_84

Redno2_85

Redno2_86

Redno2_87

Redno2_88
(immunity repressor)

Redno2_89

Redno2_90

Redno2_91

Redno2_92
(LipC)

Redno2_93

Redno2_94

Redno2_95

Redno2_96

Redno2_97

Redno2_98

Redno2_99

Redno2_100

Redno2_101

Redno2_102

Redno2_103

Redno2_104

Redno2_105

Redno2_106

Redno2_107

Redno2_108

Redno2_109

Redno2_110

Redno2_111
(AddA-like protein)

Redno2_112

Redno2_113

Redno2_114

Redno2_115
(methylase)

Redno2_116
(HNH endonuclease)

Redno2_117

Redno2_118

Redno2_119

Redno2_120
(polynucleotide kinase)

Redno2_121

Redno2_122
(endo VII)

Redno2_123
(WhiB)

Redno2_124
(HTH DNA binding domain protein)

Redno2_125

Redno2_126

Redno2_127

Redno2_128

Redno2_129
(DNA polymerase/DNA primase)

Redno2_130

Redno2_131

Redno2_132

Redno2_133

Redno2_134

Redno2_135

Redno2_136

Redno2_137

Redno2_138

Redno2_139

Redno2_140

Redno2_141

Redno2_142

Redno2_143
(DNA helicase)

Redno2_144

Redno2_145

Redno2_146

Redno2_147
(HTH DNA binding domain protein)

Redno2_148

Redno2_149

Redno2_150

Redno2_151
(DNA ligase)

Redno2_152
(ClpP protease)

Redno2_153
(DnaQ-like protein)

Redno2_154

Redno2_155

Redno2_156

Redno2_157

Redno2_158
(MazG-like protein)

Redno2_159

Redno2_160

Redno2_161

Redno2_162

Redno2_163

Redno2_164

Redno2_165

Redno2_166

Redno2_167

Redno2_168

Redno2_169
(phosphoesterase)

Redno2_170

Redno2_171

Redno2_172

Redno2_173

Redno2_174

Redno2_175

Redno2_177

Redno2_178

Redno2_179
(HIT domain protein)

Redno2_180

Redno2_181

Redno2_182

Redno2_183

Redno2_184

Redno2_185

Redno2_186

Redno2_187

Redno2_188

Redno2_189

Redno2_190

Redno2_191
(FtsK)

Redno2_192

Redno2_193

Redno2_194

Redno2_195

Redno2_196
(DNA end binding protein)

Redno2_197

Redno2_198

Redno2_199

Redno2_200

Redno2_201

Redno2_202

Redno2_203

Redno2_204

Redno2_205

Redno2_206

Redno2_207

Redno2_208

Redno2_209

Redno2_210

Redno2_211

Redno2_212

Redno2_213

Redno2_214

Redno2_215

Redno2_216

Redno2_217

Redno2_218

Redno2_219

Redno2_220

Redno2_221

Redno2_222

Redno2_223

Redno2_224

Redno2_225

Redno2_226

Redno2_227

Redno2_228

Redno2_229

Redno2_230

Redno2_231

Redno2_232

Publication Info
Uploaded to GenBank?Yes
GenBank AccessionKF114875
Refseq NumberNC_022066
Published in PaperPope, Bowman, Russell, et al 2015, eLIFE: Whole genome comparison of a large collection of mycobacteriophages reveals a continuum of phage genetic diversity
Archiving Info
Archiving status Archived
SEA Designator 2011VACURedno2ASB
SEA Lysate Titer 3.8e7
Date of SEA Lysate Titering Oct 19, 2011
Pitt Freezer Box# 30
Pitt Freezer Box Grid# 45
Available Files
Plaque PictureDownload
Restriction Digest PictureDownload
EM PictureDownload