Gordonia phage Sixama
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Detailed Information for Phage Sixama
Discovery Information
Isolation HostGordonia terrae 3612
Found ByKonstantinos Koustas
Year Found2018
Location FoundDurham, NC USA
Finding InstitutionDurham Technical Community College
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?No
Isolation Temperature35°C
GPS Coordinates36.078306 N, 79.005 W Map
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedDec 20, 2018
Sequencing FacilityPittsburgh Bacteriophage Institute
Shotgun Sequencing MethodIllumina Sequencing
Approximate Shotgun Coverage363
Genome length (bp)115454
Character of genome endsDirect Terminal Repeat
Direct Terminal Repeat Length1702 bp
GC Content52.7%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterDS
Subcluster--
Cluster Life CycleLytic
Other Cluster Members

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Annotating InstitutionDurham Technical Community College
Annotation StatusQC Complete
Has been Phamerated?Yes
Gene List

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Sixama_1

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Sixama_19

Sixama_20

Sixama_21
(membrane protein)

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Sixama_23

Sixama_24

Sixama_25
(membrane protein)

Sixama_26

Sixama_27

Sixama_28

Sixama_29

Sixama_30
(helix-turn-helix DNA binding domain)

Sixama_31

Sixama_32

Sixama_33

Sixama_34

Sixama_35
(membrane protein)

Sixama_36
(membrane protein)

Sixama_37
(membrane protein)

Sixama_38

Sixama_39
(membrane protein)

Sixama_40

Sixama_41

Sixama_42

Sixama_43

Sixama_44
(membrane protein)

Sixama_45

Sixama_46

Sixama_47

Sixama_48

Sixama_49

Sixama_50

Sixama_51

Sixama_52

Sixama_53
(polynucleotide kinase)

Sixama_54

Sixama_55

Sixama_56
(ADP-ribosyltransferase)

Sixama_57
(membrane protein)

Sixama_58

Sixama_59

Sixama_60

Sixama_61
(membrane protein)

Sixama_62
(terminase)

Sixama_63
(helix-turn-helix DNA binding domain)

Sixama_64

Sixama_65
(membrane protein)

Sixama_66
(HNH endonuclease)

Sixama_67
(WhiB family transcription factor)

Sixama_68
(MuF-like minor capsid protein)

Sixama_69
(G-I-Y Y-I-G endonuclease)

Sixama_70

Sixama_71

Sixama_72
(portal protein)

Sixama_73

Sixama_74

Sixama_75
(ADP-ribosyltransferase)

Sixama_76

Sixama_77

Sixama_78

Sixama_79
(capsid maturation protease)

Sixama_80

Sixama_81
(major capsid protein)

Sixama_82

Sixama_83

Sixama_84
(head-to-tail adaptor)

Sixama_85

Sixama_86

Sixama_87

Sixama_88

Sixama_89
(tyrosine integrase)

Sixama_90

Sixama_91
(glycosyltransferase)

Sixama_92
(glycosyltransferase)

Sixama_93

Sixama_94
(major tail protein)

Sixama_95

Sixama_96

Sixama_97
(tape measure protein)

Sixama_98
(minor tail protein)

Sixama_99
(minor tail protein)

Sixama_100
(membrane protein)

Sixama_101

Sixama_102

Sixama_103

Sixama_104
(minor tail protein)

Sixama_105

Sixama_106
(lysin A, protease C39 domain)

Sixama_107
(lysin A, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain)

Sixama_108

Sixama_109
(cysteine protease)

Sixama_110
(holin)

Sixama_111
(membrane protein)

Sixama_112
(membrane protein)

Sixama_113
(membrane protein)

Sixama_114

Sixama_115

Sixama_116

Sixama_117
(AAA-ATPase)

Sixama_118
(WhiB family transcription factor)

Sixama_119

Sixama_120
(DNA methylase)

Sixama_121

Sixama_122
(MazG-like nucleotide pyrophosphohydrolase)

Sixama_123

Sixama_124
(membrane protein, Band-7 -like)

Sixama_125

Sixama_126
(glycosyltransferase)

Sixama_127

Sixama_128

Sixama_134
(HNH endonuclease)

Sixama_138

Sixama_140

Sixama_142

Sixama_146

Sixama_151
(HNH endonuclease)

Sixama_163
(Ro-like RNA binding protein)

Sixama_164

Sixama_165
(RecA-like DNA Recombinase)

Sixama_166
(Cas4 family exonuclease)

Sixama_167

Sixama_168
(DNA helicase)

Sixama_169
(DprA-like DNA processing chain A)

Sixama_170
(RuvC-like resolvase)

Sixama_171

Sixama_172
(DNA polymerase I)

Sixama_173
(G-I-Y Y-I-G endonuclease)

Sixama_174

Sixama_175
(deoxycytidylate deaminase)

Sixama_176
(HNH endonuclease)

Sixama_177

Sixama_178

Sixama_179
(thymidylate synthase)

Sixama_180
(thymidylate kinase)

Sixama_181
(G-I-Y Y-I-G endonuclease)

Sixama_182

Sixama_183
(lysin B)

Sixama_184

Sixama_185

Sixama_186

Sixama_187
(helix-turn-helix DNA binding domain)

Sixama_188

Sixama_189

Sixama_190
(helix-turn-helix DNA binding domain)

Sixama_191

Sixama_192

Sixama_193
(DNAB-like dsDNA helicase)

Sixama_194
(DNA primase/polymerase)

Sixama_195

Sixama_196

Sixama_197

Sixama_198

Sixama_199

Sixama_200

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