Details for Cluster F phages
List of all clusters
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Members Subclusters Avg Size (bp) Avg GC% Avg Genes Avg tRNAs
263 7 57,381 61.5 104.3 0.0
Subclusters
F1 (246) F2 (8) F3 (1) F4 (4) F5 (1) F6 (1) F7 (1)

Cluster F phages infect hosts in the following genus

Mycobacterium

Lysogeny notes for Cluster F phages

Phages in this cluster are generally temperate. (This does not, however, guarantee that every single phage will be able to form lysogens, as some may have had important lysogeny genes deleted.)

This assessment has been made experimentally, meaning real lysogens have been made and verified for at least some phages in this cluster.

Cluster F lysogens have an abundant amount of plaques on the plate.

Papers related to Cluster F phages

Hatfull, GF (2012): The secret lives of mycobacteriophages.

Pham TT et al (2007): Comparative genomic analysis of mycobacteriophage Tweety: evolutionary insights and construction of compatible site-specific integration vectors for mycobacteria.

List of Microbiology Resource Announcements with Cluster F phages

Bass et al (2024): Complete genome sequences of mycobacteriophages Ageofdapage, Aubs, BABullseye, CheetoDust, ShaboiShabazz, and TomBrady

Pelagalli et al (2024): Mycobacteriophage maravista: a cluster F1 phage discovered on Cape Cod, Massachusetts

Kim et al (2023): Complete genome sequences of cluster F1 and cluster B1 Mycobacterium smegmatis phages Karhdo and Basato

Frost et al (2022): Complete Genome Sequences of Mycobacterium smegmatis Phages MelsMeow, Yorick, Virgeve, and Mikro

Ahsan et al (2022): Complete Genome Sequences of Cluster F1 Mycobacteriophages Akhila and MilanaBonita

Byrum et al (2020): Complete Genome Sequence of the Cluster F1 Mycobacteriophage KingMidas

Katsanos et al (2020): Genome Sequences of Two F1 Subcluster Bacteriophages, Burwell21 and Nivrat, Isolated Using the Bacterial Host Mycobacterium smegmatis

Davis et al (2020): Genome Sequences of the Mycobacteriophages Awesomesauce and LastJedi

Jacob et al (2019): Complete Genome Sequences of Cluster F Mycobacteriophages EleanorGeorge, Mattes, and Spikelee

Davies et al (2019): Complete Genome Sequences of Nine Mycobacteriophages from New Zealand, Beatrix, Carthage, Daegal, Dulcie, Fancypants, Fenn, Inca, Naira, and Robyn

Fast KM et al (2018): Genome Sequence of a Newly Isolated F2 Subcluster Mycobacteriophage from the Black Belt Geological Region of Western Alabama

Chudoff D et al (2016): Genome Sequence of Mycobacteriophage Cabrinians.

Cluster F phages
Phages - of
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Phage Name

Host Genus

Subcluster

Genome (bp)

GC%

Genes

tRNAs

Year Found
Blarby Mycobacterium None 55293 61.7 109 0 2023
Akhila Mycobacterium F1 56251 62.1 99 0 2019
Alexphander Mycobacterium F1 57734 61.2 104 0 2016
Aloeri Mycobacterium F1 56529 62.8 95 0 2024
AlpineSix Mycobacterium F1 56721 61.1 102 0 2019
ArcusAngelus Mycobacterium F1 58569 61.4 103 0 2016
Ardmore Mycobacterium F1 52141 61.5 87 0 2009
Aubs Mycobacterium F1 58937 61.4 103 0 2021
Awesomesauce Mycobacterium F1 57054 62.9 94 1 2015
Batiatus Mycobacterium F1 57737 61.8 105 0 2010
Beakin Mycobacterium F1 54926 61.2 99 0 2021
BigPhil Mycobacterium F1 53618 61.5 100 0 2014
Bipolar Mycobacterium F1 58985 61.4 106 0 2013
Blexus Mycobacterium F1 58824 61.4 101 0 2018
BlueCrab Mycobacterium F1 59136 61.3 109 0 2022
BobaPhett Mycobacterium F1 59815 61.3 108 0 2015
Bobi Mycobacterium F1 59179 61.7 107 0 2010
BodEinwohner17 Mycobacterium F1 60222 61.3 116 0 2017
Boomer Mycobacterium F1 58037 61.1 105 0 2005
Brocalys Mycobacterium F1 54751 61.8 96 0 2013
Brookers Mycobacterium F1 56569 61.2 102 0 2024
Brushbloom Mycobacterium F1 58749 61.7 106 0 2024
Bubbles123 Mycobacterium F1 57647 61.4 100 0 2012
Burwell21 Mycobacterium F1 58098 61.5 100 0 2017
BuzzLyseyear Mycobacterium F1 59419 61.1 110 0 2013
ByChance Mycobacterium F1 53123 61.3 95 0 2017
Byougenkin Mycobacterium F1 54685 61.4 101 0 2015
Cabrinians Mycobacterium F1 56669 61.2 101 0 2012
CaptainTrips Mycobacterium F1 57328 61.5 107 0 2012
Cerasum Mycobacterium F1 53636 61.5 102 0 2013
Che8 Mycobacterium F1 59472 61.3 115 0 2002
Cheesepuff Mycobacterium F1 57052 61.4 108 0 2023
Chevrolet Mycobacterium F1 58570 61.4 108 0 2023
ChickenDinner Mycobacterium F1 56529 62.8 94 0 2022
Chuckly Mycobacterium F1 55189 61.6 102 0 2016
Clifton Mycobacterium F1 55727 61.7 96 0 2017
Coco12 Mycobacterium F1 57693 61.1 104 0 2012
Corium Mycobacterium F1 59356 61.8 103 0 2024
Cornucopia Mycobacterium F1 55422 61.4 105 0 2016
Crumble Mycobacterium F1 53424 61.4 99 0 2023
DaddyRickover Mycobacterium F1 57877 61.5 106 0 2021
Daenerys Mycobacterium F1 58043 61.6 102 0 2012
Dante Mycobacterium F1 59652 61.8 105 0 2011
DaWorst Mycobacterium F1 56827 61.0 103 0 2016
DeadP Mycobacterium F1 56461 61.6 106 0 2009
Deb65 Mycobacterium F1 55767 61.6 97 0 2023
DillTech15 Mycobacterium F1 57797 61.9 111 0 2015
DirtMcgirt Mycobacterium F1 54396 61.1 104 0 2012
DLane Mycobacterium F1 58899 61.9 105 0 2005
DocMcStuffins Mycobacterium F1 58159 62.7 91 0 2023
Donkeykong Mycobacterium F1 59478 61.9 110 0 2018
Doomphist Mycobacterium F1 58666 61.5 108 0 2017
DoRead Mycobacterium F1 56181 61.1 108 0 2024
Dorothy Mycobacterium F1 58866 61.4 104 0 2011
DosHalletts Mycobacterium F1 57562 61.3 101 0 2023
DotProduct Mycobacterium F1 55363 61.8 98 0 2009
Doug Mycobacterium F1 58397 61.1 99 0 2018
Drago Mycobacterium F1 54411 61.2 103 0 2010
DRBy19 Mycobacterium F1 58368 61.3 104 0 2015
Eish Mycobacterium F1 58150 61.2 109 0 2018
EleanorGeorge Mycobacterium F1 59482 61.7 108 0 2016
EmiMonkey Mycobacterium F1 58584 61.6 91 0 2024
Emma Mycobacterium F1 56418 61.3 109 0 2015
Emmaloid Mycobacterium F1 57713 61.2 108 0 2024
Empress Mycobacterium F1 57155 61.5 104 0 2012
Enby Mycobacterium F1 54687 61.3 107 0 2017
Eradicator Mycobacterium F1 55730 61.3 95 0 2019
Estave1 Mycobacterium F1 60727 61.3 112 0 2012
Fancypants Mycobacterium F1 60228 61.1 110 0 2018
Fastidio Mycobacterium F1 55839 61.6 108 0 2023
Filuzino Mycobacterium F1 59306 62.1 105 0 2014
Firehouse51 Mycobacterium F1 58166 61.5 98 0 2013
Flathead Mycobacterium F1 57663 61.2 108 0 2015
Florinda Mycobacterium F1 59416 61.7 117 0 2011
Frankie Mycobacterium F1 57036 61.9 103 0 2016
FreddyB Mycobacterium F1 58318 61.7 113 0 2023
Fruitloop Mycobacterium F1 58471 61.8 102 0 2005
Galactic Mycobacterium F1 57861 61.4 109 0 2016
Gandalph Mycobacterium F1 54974 61.4 104 0 2011
Geralt Mycobacterium F1 55765 61.5 97 0 2015
GigiOuiOui Mycobacterium F1 56389 61.6 99 0 2018
Girafales Mycobacterium F1 58456 61.7 112 0 2011
Girr Mycobacterium F1 57754 61.4 102 1 2012
Gorge Mycobacterium F1 57955 61.4 103 0 2017
Grimmer Mycobacterium F1 55294 61.3 111 0 2018
GUmbie Mycobacterium F1 57387 61.4 104 0 2010
Guppsters Mycobacterium F1 54835 61.5 99 0 2023
Hades Mycobacterium F1 54986 61.4 102 0 2010
Hamulus Mycobacterium F1 57155 61.8 105 0 2008
Harley Mycobacterium F1 58731 61.4 107 0 2015
Hegedechwinu Mycobacterium F1 57346 61.5 112 0 2011
Hlubikazi Mycobacterium F1 55471 61.4 102 0 2018
Ibhubesi Mycobacterium F1 55600 61.2 103 0 2008
IbOuu Mycobacterium F1 55297 61.4 102 0 2023
IMpilo Mycobacterium F1 55933 61.8 102 0 2023
Inventum Mycobacterium F1 57052 61.4 102 0 2012
IrishSherpFalk Mycobacterium F1 58575 61.6 106 0 2013
JalFarm20 Mycobacterium F1 58768 61.4 112 0 2020
James Mycobacterium F1 59617 61.4 108 0 2015
Jant Mycobacterium F1 57829 61.8 113 0 2024
Jarcob Mycobacterium F1 58937 61.3 107 0 2021
Jinglebell Mycobacterium F1 58829 61.1 111 0 2023
Job42 Mycobacterium F1 59626 61.2 106 0 2011
JoeyJr Mycobacterium F1 58962 61.4 107 0 2017
Juice456 Mycobacterium F1 56726 61.6 102 0 2018
Juniper1 Mycobacterium F1 57275 61.2 99 0 2022
Karhdo Mycobacterium F1 55379 61.5 100 0 2022
Kenuha5 Mycobacterium F1 56502 61.7 96 0 2017
Kersh Mycobacterium F1 60190 61.2 107 0 2014
Kimberlium Mycobacterium F1 56826 61.4 105 0 2014
KingJulian Mycobacterium F1 60220 61.9 112 0 2024
KingMidas Mycobacterium F1 57386 61.4 105 0 2016
Kingsley Mycobacterium F1 60300 61.4 112 0 2015
Koella Mycobacterium F1 54118 61.5 95 1 2015
Krakatau Mycobacterium F1 53058 61.5 97 0 2008
KristaRAM Mycobacterium F1 58701 61.6 113 0 2016
LastJedi Mycobacterium F1 55149 61.8 94 0 2018
Latretium Mycobacterium F1 59282 61.2 107 0 2017
Leozinho Mycobacterium F1 54280 61.2 99 0 2020
Leperchaun Mycobacterium F1 58194 61.6 106 0 2012
LilMoolah Mycobacterium F1 58136 61.5 106 0 2017
LittleShirley Mycobacterium F1 58611 61.5 112 0 2023
Lizziana Mycobacterium F1 58423 61.3 105 0 2017
Llama Mycobacterium F1 58472 61.1 111 0 2012
Llij Mycobacterium F1 56852 61.5 100 0 2003
Lorde Mycobacterium F1 53852 61.2 106 0 2017
LunaBlu Mycobacterium F1 59283 61.5 111 0 2022
Madiba Mycobacterium F1 56056 61.4 102 0 2018
MadMen Mycobacterium F1 57759 61.3 109 0 2020
Mahavrat Mycobacterium F1 55945 61.3 99 0 2016
Mandlovu Mycobacterium F1 55413 61.4 101 0 2018
Mantra Mycobacterium F1 57001 61.5 102 0 2008
Maravista Mycobacterium F1 60140 61.3 104 0 2022
Marker Mycobacterium F1 58811 61.0 109 1 2023
Martik Mycobacterium F1 58855 61.6 103 0 2019
Mattes Mycobacterium F1 58074 61.3 105 0 2016
Medindi Mycobacterium F1 58681 61.9 110 0 2025
Melissauren88 Mycobacterium F1 54356 61.8 95 0 2015
MilanaBonita Mycobacterium F1 56251 62.1 99 0 2018
MilleniumForce Mycobacterium F1 58106 61.8 104 0 2012
MinionDave Mycobacterium F1 58027 61.5 103 0 2013
Minnie Mycobacterium F1 59268 61.5 100 0 2013
Misha28 Mycobacterium F1 57455 62.9 93 0 2016
MisterCuddles Mycobacterium F1 57754 61.4 103 1 2012
Modragons Mycobacterium F1 58461 61.1 107 0 2017
Moonbeam Mycobacterium F1 57984 61.1 107 0 2017
Mova Mycobacterium F1 57599 61.3 106 0 2018
Mozy Mycobacterium F1 57278 61.1 108 0 2007
Ms6 Mycobacterium F1 54246 62.1 108 0 1989
MulchExplorer Mycobacterium F1 56497 61.4 108 0 2014
Mutaforma13 Mycobacterium F1 57701 61.3 106 0 2010
Mwanjiwa Mycobacterium F1 58863 61.3 107 0 2025
NewHope4 Mycobacterium F1 57409 61.5 112 0 2024
Nimbo Mycobacterium F1 55767 61.5 96 0 2017
Nitzel Mycobacterium F1 54857 61.3 98 0 2015
Nivrat Mycobacterium F1 58009 61.5 103 0 2017
NormanBulbieJr Mycobacterium F1 58102 61.3 102 0 2017
Ochi17 Mycobacterium F1 58069 61.0 110 0 2017
OfUltron Mycobacterium F1 58617 61.1 111 0 2016
Ogopogo Mycobacterium F1 56867 61.1 110 0 2008
Oksu Mycobacterium F1 59317 60.9 107 0 2022
OldBen Mycobacterium F1 57159 61.5 101 0 2016
OlympiaSaint Mycobacterium F1 58297 61.4 107 0 2011
Ovechkin Mycobacterium F1 58338 62.0 106 0 2010
OwlsT2W Mycobacterium F1 56515 61.2 103 0 2014
Pacc40 Mycobacterium F1 58554 61.3 101 0 2004
Peridot Mycobacterium F1 57157 61.4 106 0 2023
Phalconet Mycobacterium F1 57648 61.7 106 0 2021
Phanphagia Mycobacterium F1 59699 61.6 110 0 2012
PHappiness Mycobacterium F1 57989 61.6 104 0 2017
Phasih Mycobacterium F1 56125 61.1 100 0 2015
Phatniss Mycobacterium F1 57293 61.3 101 0 2013
PhesterPhotato Mycobacterium F1 57622 61.7 109 0 2023
Philus Mycobacterium F1 59235 61.4 108 0 2014
PhlipPhlop Mycobacterium F1 58584 61.6 92 0 2024
Piper2020 Mycobacterium F1 57703 62.7 98 0 2016
Pippy Mycobacterium F1 56663 61.5 103 0 2012
Plumbus Mycobacterium F1 54468 61.1 102 0 2016
PMC Mycobacterium F1 56692 61.4 104 0 2004
Poenanya Mycobacterium F1 58666 61.5 107 0 2017
Polka14 Mycobacterium F1 58758 61.4 108 0 2014
Pollywog Mycobacterium F1 58397 61.3 105 0 2017
Polo2Bam Mycobacterium F1 57263 61.5 117 0 2024
PopTart Mycobacterium F1 55094 61.6 95 0 2012
Priscilla Mycobacterium F1 58230 61.3 105 0 2015
QuickMath Mycobacterium F1 57526 61.7 105 0 2017
Quico Mycobacterium F1 58671 61.7 112 0 2011
Radiance Mycobacterium F1 57325 61.2 103 0 2022
Ramsey Mycobacterium F1 58578 61.2 108 0 2006
RedBird Mycobacterium F1 58738 61.5 105 0 2022
Rialto Mycobacterium F1 57936 61.2 108 0 2018
Rita Mycobacterium F1 58771 61.6 104 0 2021
RitaG Mycobacterium F1 57789 61.6 103 0 2015
Rockne Mycobacterium F1 56704 61.4 108 0 2012
RockyHorror Mycobacterium F1 56719 61.1 107 0 2009
Royals2015 Mycobacterium F1 57356 61.7 109 0 2015
Ruby Mycobacterium F1 57726 61.4 99 1 2010
Saal Mycobacterium F1 57775 61.3 101 0 2011
Sabbb Mycobacterium F1 55731 61.3 107 0 2015
Sandalphon Mycobacterium F1 59540 61.4 104 0 2017
Sarma624 Mycobacterium F1 54312 61.5 105 0 2012
Sassafras Mycobacterium F1 57051 61.4 106 0 2010
SassyB Mycobacterium F1 55094 61.6 95 0 2012
Scottish Mycobacterium F1 56825 61.5 105 0 2015
Seabastian Mycobacterium F1 58618 61.1 111 0 2016
Seagreen Mycobacterium F1 57766 61.8 105 0 2014
SG4 Mycobacterium F1 59016 61.9 105 0 2005
Shauna1 Mycobacterium F1 59315 61.7 107 0 2010
ShiLan Mycobacterium F1 59794 61.4 107 0 2009
ShowerHandel Mycobacterium F1 57562 61.4 107 0 2023
ShroomBoi Mycobacterium F1 58221 61.4 105 0 2022
SimranZ1 Mycobacterium F1 56335 61.3 103 0 2016
SiSi Mycobacterium F1 56279 61.5 99 0 2011
Slim Mycobacterium F1 57704 61.2 108 0 2024
Sparkdehlily Mycobacterium F1 56275 61.2 111 0 2014
Spartacus Mycobacterium F1 61164 61.7 110 0 2009
Spikelee Mycobacterium F1 58604 61.0 104 0 2017
Spoonbill Mycobacterium F1 55735 61.3 103 0 2010
StAnnes Mycobacterium F1 59357 61.8 110 0 2018
Stap Mycobacterium F1 54395 61.3 99 0 2022
Starcevich Mycobacterium F1 58274 61.2 106 0 2022
Strokeseat Mycobacterium F1 55470 61.4 101 0 2018
SuperGrey Mycobacterium F1 59346 61.7 103 0 2013
SwagPigglett Mycobacterium F1 58930 61.3 106 0 2016
Taj Mycobacterium F1 58550 61.9 110 0 2009
Tchotchke Mycobacterium F1 55682 61.1 96 0 2023
TDanisky Mycobacterium F1 56275 61.2 111 0 2015
TootsiePop Mycobacterium F1 57455 62.9 93 0 2016
Tootsieroll Mycobacterium F1 57595 61.4 96 0 2020
Topiatin Mycobacterium F1 59361 61.5 107 0 2025
Totinger Mycobacterium F1 57450 61.5 106 0 2008
Tweety Mycobacterium F1 58692 61.7 109 0 2004
UncleRicky Mycobacterium F1 57256 61.3 105 0 2016
Velveteen Mycobacterium F1 54314 61.5 100 0 2012
Veteran Mycobacterium F1 56147 61.5 94 0 2012
Violac Mycobacterium F1 58196 61.3 104 0 2024
Vivum Mycobacterium F1 59909 61.6 106 0 2024
VRedHorse Mycobacterium F1 54800 61.4 105 0 2018
Wachhund Mycobacterium F1 54513 61.7 101 0 2016
Wee Mycobacterium F1 59230 61.8 109 0 2009
Whatsapiecost Mycobacterium F1 53598 61.8 100 0 2017
Whouxphf Mycobacterium F1 59093 61.1 108 0 2014
WillSterrel Mycobacterium F1 58608 61.6 104 0 2015
XFactor Mycobacterium F1 55617 61.7 95 0 2014
Yorick Mycobacterium F1 59227 61.3 99 0 2021
Zerg Mycobacterium F1 58079 61.2 104 0 2013
Zizzle Mycobacterium F1 59381 61.5 108 0 2020
Avani Mycobacterium F2 54470 61.0 107 0 2011
Che9d Mycobacterium F2 56275 60.9 111 0 2002
Demsculpinboyz Mycobacterium F2 57437 60.9 117 0 2016
Jabbawokkie Mycobacterium F2 55213 61.1 106 0 2012
SilverChicken Mycobacterium F2 57439 61.2 109 0 2024
Soul22 Mycobacterium F2 54814 61.5 102 0 2019
Yoshi Mycobacterium F2 58714 61.0 116 0 2009
Zapner Mycobacterium F2 55307 61.1 108 0 2013
Squirty Mycobacterium F3 60285 62.4 102 0 2012
LunaStella Mycobacterium F4 55791 62.4 101 0 2023
Renaud18 Mycobacterium F4 58078 61.7 112 0 2014
TChen Mycobacterium F4 57742 62.3 101 0 2015
ThetaBob Mycobacterium F4 56714 61.7 106 0 2014
Cornie Mycobacterium F5 56391 61.4 101 0 2016
Toron Mycobacterium F6 59328 61.0 106 0 2022
MulchSalad Mycobacterium F7 58415 62.7 105 0 2022
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