Streptomyces phage GiJojo
Know something about this phage that we don't? Modify its data.
Detailed Information for Phage GiJojo
Discovery Information
Isolation HostStreptomyces mirabilis NRRL B-2400
Former namesSheryl
Found ByDriwech,Oumaima & Fritz,Lily
Year Found2023
Location FoundCatonsville, MD USA
Finding InstitutionUniversity of Maryland, Baltimore County
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?No
Isolation Temperature30°C
GPS Coordinates39.25536 N, 76.711944 W Map
Discovery NotesSoil was collected on 10/24/2023 outside of the UMBC Biology building exit door. The ambient temperature was 18.3 C. Soil was dug around 3-4 inches below the surface. The soil was collected by Abdullah Bajwah and Zain Naeem
Naming NotesWe chose the name GiJojo because we had to have a lot of time and patience to get his phage and it was very resilient.
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedJan 19, 2024
Sequencing FacilityPittsburgh Bacteriophage Institute
Shotgun Sequencing MethodIllumina
Approximate Shotgun Coverage235
Genome length (bp)115161
Character of genome endsDirect Terminal Repeat
Direct Terminal Repeat Length197 bp
GC Content53.5%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterBS
Subcluster--
Cluster Life CycleUnknown
Lysogeny NotesLysogeny testing was not performed.
Other Cluster Members
Annotating InstitutionUniversity of Maryland, Baltimore County
Annotation StatusIn GenBank
Plaque NotesClear, circular, smooth edges, symmetrical
MorphotypeMyoviridae
Number of Genes180
Number of tRNAs29
Number of tmRNAs0
Has been Phamerated?Yes
Gene List

Click to View

GiJojo_1

GiJojo_2
(HNH endonuclease)

GiJojo_3

GiJojo_4

GiJojo_5

GiJojo_6

GiJojo_7
(ribbon-helix-helix DNA binding domain protein)

GiJojo_8

GiJojo_9
(minor tail protein)

GiJojo_10 — tRNA
(tRNA-Pro(tgg))

GiJojo_11 — tRNA
(tRNA-Phe(gaa))

GiJojo_12 — tRNA
(tRNA-Met(cat))

GiJojo_13 — tRNA
(tRNA-Met(cat))

GiJojo_14 — tRNA
(tRNA-Gly(tcc))

GiJojo_15 — tRNA
(tRNA-Gln(ctg))

GiJojo_16 — tRNA
(tRNA-Gln(ttg))

GiJojo_17 — tRNA
(tRNA-Asp(gtc))

GiJojo_18 — tRNA
(tRNA-Glu(ctc))

GiJojo_19 — tRNA
(tRNA-Glu(ttc))

GiJojo_20

GiJojo_21 — tRNA
(tRNA-Thr(tgt))

GiJojo_22 — tRNA
(tRNA-Thr(cgt))

GiJojo_23 — tRNA
(tRNA-Thr(ggt))

GiJojo_24 — tRNA
(tRNA-Leu(caa))

GiJojo_25 — tRNA
(tRNA-Leu(tag))

GiJojo_26

GiJojo_27 — tRNA
(tRNA-Trp(cca))

GiJojo_28 — tRNA
(tRNA-Asn(gtt))

GiJojo_29 — tRNA
(tRNA-Arg(cct))

GiJojo_30
(Ro-like RNA binding protein)

GiJojo_31 — tRNA
(tRNA-Ala(tgc))

GiJojo_32 — tRNA
(tRNA-Lys(ctt))

GiJojo_33 — tRNA
(tRNA-Lys(ttt))

GiJojo_34

GiJojo_35
(peptidase)

GiJojo_36
(CobT-like cobalamin biosynthesis protein)

GiJojo_37

GiJojo_38 — tRNA
(tRNA-Arg(acg))

GiJojo_39

GiJojo_40 — tRNA
(tRNA-Arg(tct))

GiJojo_41

GiJojo_42

GiJojo_43 — tRNA
(tRNA-Val(tac))

GiJojo_44

GiJojo_45 — tRNA
(tRNA-Ser(gct))

GiJojo_46 — tRNA
(tRNA-Ser(gga))

GiJojo_47 — tRNA
(tRNA-Ile(gat))

GiJojo_48
(thioredoxin)

GiJojo_49 — tRNA
(tRNA-His(gtg))

GiJojo_50

GiJojo_51 — tRNA
(tRNA-Tyr(gta))

GiJojo_52
(RNA ligase)

GiJojo_53

GiJojo_54
(HNH endonuclease)

GiJojo_55
(phosphoesterase)

GiJojo_56
(MazG-like nucleotide pyrophosphohydrolase)

GiJojo_57

GiJojo_58

GiJojo_59

GiJojo_60

GiJojo_61
(terminase)

GiJojo_62

GiJojo_63

GiJojo_64

GiJojo_65

GiJojo_66

GiJojo_67

GiJojo_68

GiJojo_69
(portal protein)

GiJojo_70
(scaffolding protein)

GiJojo_71
(major capsid protein)

GiJojo_72

GiJojo_73

GiJojo_74

GiJojo_75

GiJojo_76
(tailspike protein)

GiJojo_77

GiJojo_78

GiJojo_79
(tail terminator)

GiJojo_80
(tail sheath protein)

GiJojo_81
(tail tube protein)

GiJojo_82

GiJojo_83

GiJojo_84

GiJojo_85
(minor tail protein)

GiJojo_86

GiJojo_87
(minor tail protein)

GiJojo_88
(minor tail protein)

GiJojo_89
(baseplate wedge protein)

GiJojo_90
(baseplate J protein)

GiJojo_91

GiJojo_92
(minor tail protein)

GiJojo_93
(minor tail protein)

GiJojo_94

GiJojo_95

GiJojo_96

GiJojo_97

GiJojo_98

GiJojo_99

GiJojo_100

GiJojo_101
(DnaC-like helicase loader)

GiJojo_102

GiJojo_103

GiJojo_104

GiJojo_105
(nucleotidyl transferase)

GiJojo_106
(PnuC-like nicotinamide riboside transporter)

GiJojo_107
(polynucleotide kinase)

GiJojo_108

GiJojo_109

GiJojo_110

GiJojo_111

GiJojo_112

GiJojo_113
(DnaB-like dsDNA helicase)

GiJojo_114
(DNA primase)

GiJojo_115
(HNH endonuclease)

GiJojo_116
(DNA helicase)

GiJojo_117
(host nuclease inhibitor)

GiJojo_118

GiJojo_119

GiJojo_120

GiJojo_121

GiJojo_122

GiJojo_123

GiJojo_124

GiJojo_125

GiJojo_126

GiJojo_127
(MerR-like helix-turn-helix DNA binding domain protein)

GiJojo_128

GiJojo_129
(SSB protein)

GiJojo_130

GiJojo_131

GiJojo_132
(DNA polymerase I)

GiJojo_133

GiJojo_134

GiJojo_135
(ribonucleotide reductase)

GiJojo_136

GiJojo_137

GiJojo_138
(RecA-like DNA recombinase)

GiJojo_139

GiJojo_140

GiJojo_141
(RNA ligase)

GiJojo_142

GiJojo_143

GiJojo_144

GiJojo_145

GiJojo_146

GiJojo_147

GiJojo_148
(Holliday junction resolvase)

GiJojo_149
(WhiB family transcription factor)

GiJojo_150
(Cas4 exonuclease)

GiJojo_151
(DNA binding protein)

GiJojo_152

GiJojo_153
(ThyX-like thymidylate synthase)

GiJojo_154

GiJojo_155

GiJojo_156

GiJojo_157

GiJojo_158

GiJojo_159
(helix-turn-helix DNA binding domain protein)

GiJojo_160
(DprA-like DNA processing chain A)

GiJojo_161

GiJojo_162

GiJojo_163
(RuvC-like resolvase)

GiJojo_164

GiJojo_165

GiJojo_166

GiJojo_167

GiJojo_168

GiJojo_169

GiJojo_170

GiJojo_171

GiJojo_172
(HNH endonuclease)

GiJojo_173
(peptidase)

GiJojo_174
(hydrolase)

GiJojo_175

GiJojo_176

GiJojo_177
(endolysin)

GiJojo_178

GiJojo_179
(hydrolase)

GiJojo_180

GiJojo_181
(dpdA-like tRNA-guanine transglycosylase)

GiJojo_182

GiJojo_183

GiJojo_184
(endonuclease VII)

GiJojo_185

GiJojo_186

GiJojo_187

GiJojo_188

GiJojo_189
(ArdA-like antirestriction protein)

GiJojo_190

GiJojo_191

GiJojo_192

GiJojo_193

GiJojo_194

GiJojo_195

GiJojo_196

GiJojo_197

GiJojo_198

GiJojo_199

GiJojo_200

GiJojo_201

GiJojo_202

GiJojo_203

GiJojo_204

GiJojo_205

GiJojo_206

GiJojo_207

GiJojo_208

GiJojo_209

Submitted Minimal DNA Master FileDownload
Publication Info
Uploaded to GenBank?Yes
GenBank AccessionPP725410
Refseq NumberNone yet
Archiving Info
Archiving status Archived
Pitt Freezer Box# 171
Pitt Freezer Box Grid# C1
Available Files
Plaque PictureDownload
Restriction Digest PictureDownload
EM PictureDownload
GenBank File for PhameratorDownload