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Gordonia phage Octobien14
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Detailed Information for Phage Octobien14
Discovery Information
Isolation HostGordonia terrae 3612
Found ByBienfaiteur Mugisha
Year Found2017
Location FoundDurham, NC USA
Finding InstitutionDurham Technical Community College
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?Yes
Isolation TemperatureNot entered
GPS Coordinates35.9492 N, 78.968 W Map
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedDec 19, 2017
Sequencing FacilityPittsburgh Bacteriophage Institute
Shotgun Sequencing MethodIllumina Sequencing
Approximate Shotgun Coverage739
Genome length (bp)76358
Character of genome ends3' Sticky Overhang
Overhang Length11 bases
Overhang SequenceATCTGCGCCCC
GC Content58.7%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterDU
Subcluster--
Cluster Life CycleUnknown
Other Cluster Members

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Annotation StatusIn GenBank
Has been Phamerated?Yes
Gene List

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Octobien14_1
(HNH endonuclease)

Octobien14_2

Octobien14_3

Octobien14_4

Octobien14_5
(helix-turn-helix DNA binding domain)

Octobien14_6
(integrase, (Y-int))

Octobien14_7

Octobien14_8

Octobien14_9

Octobien14_10

Octobien14_11

Octobien14_12
(terminase, small subunit)

Octobien14_13
(terminase, large subunit)

Octobien14_14
(portal protein)

Octobien14_15
(capsid maturation protease)

Octobien14_16
(scaffolding protein)

Octobien14_17
(major capsid protein)

Octobien14_18
(head-to-tail adaptor)

Octobien14_19
(head-to-tail stopper)

Octobien14_20

Octobien14_21

Octobien14_22
(major tail protein)

Octobien14_23
(tail assembly chaperone)

Octobien14_24
(tail assembly chaperone)

Octobien14_25

Octobien14_26
(tape measure protein)

Octobien14_27
(minor tail protein)

Octobien14_28
(minor tail protein)

Octobien14_29

Octobien14_30
(minor tail protein)

Octobien14_31

Octobien14_32

Octobien14_33
(minor tail protein)

Octobien14_34
(minor tail protein)

Octobien14_35
(lysin A, protease C39 domain)

Octobien14_36
(lysin A, peptidoglycan binding domain)

Octobien14_37
(holin)

Octobien14_38

Octobien14_39
(Lsr2-like DNA bridging protein)

Octobien14_40

Octobien14_41

Octobien14_42
(membrane protein)

Octobien14_43
(immunity repressor)

Octobien14_44
(helix-turn-helix DNA binding domain)

Octobien14_45

Octobien14_46

Octobien14_47

Octobien14_48

Octobien14_49

Octobien14_50

Octobien14_51

Octobien14_52

Octobien14_53

Octobien14_54
(membrane protein, Band-7 -like)

Octobien14_55
(MazG-like nucleotide pyrophosphohydrolase)

Octobien14_56

Octobien14_57

Octobien14_58
(exonuclease)

Octobien14_59

Octobien14_60
(ssDNA binding protein, ERF family)

Octobien14_61

Octobien14_62

Octobien14_63

Octobien14_64

Octobien14_65

Octobien14_66
(Whib family transcription factor)

Octobien14_67
(Whib family transcription factor)

Octobien14_68
(helix-turn-helix DNA binding domain)

Octobien14_69

Octobien14_70

Octobien14_71

Octobien14_72
(HNH endonuclease)

Octobien14_73

Octobien14_74

Octobien14_75

Octobien14_76

Octobien14_77
(DnaB-like dsDNA helicase)

Octobien14_78

Octobien14_79
(ssDNA binding protein)

Octobien14_80

Octobien14_81

Octobien14_82

Octobien14_83
(RusA-like resolvase (endonuclease))

Octobien14_84

Octobien14_85

Octobien14_86
(polynucleotide kinase)

Octobien14_87

Octobien14_88
(RNA ligase)

Octobien14_89

Octobien14_90
(phosphoribosyl transferase)

Octobien14_91
(nicotinate ribosyltransferase)

Octobien14_92

Octobien14_93
(Nucleotidyl transferase)

Octobien14_94
(helix-turn-helix DNA binding domain)

Octobien14_100

Octobien14_101

Octobien14_102

Octobien14_103

Octobien14_104

Octobien14_106

Octobien14_107
(ThyX-like thymidylate synthase)

Octobien14_108

Octobien14_109
(ribonucleotide reductase)

Octobien14_110
(NrdH-like glutaredoxin)

Octobien14_111

Octobien14_112
(exonuclease)

Octobien14_113
(membrane protein)

Octobien14_114

Octobien14_115
(lysin B)

Octobien14_116

Octobien14_117
(AAA-ATPase)

Octobien14_118
(glycosyltransferase)

Octobien14_119

Octobien14_120
(galactosyltransferase)

Octobien14_121
(glycosyltransferase)

Octobien14_122

Octobien14_123

Octobien14_124
(HNH endonuclease)

Octobien14_125

Octobien14_126

Octobien14_127

Octobien14_128

Octobien14_129

Octobien14_130
(helix-turn-helix DNA binding domain)

Octobien14_131

Octobien14_132

Octobien14_133
(antirestriction protein, ArdA-like)

Octobien14_134

Octobien14_135

Octobien14_136

Octobien14_137

Octobien14_138

Octobien14_139

Octobien14_140

Octobien14_141

Octobien14_142

Octobien14_143

Octobien14_144

Octobien14_145
(AAA-ATPase)

Octobien14_146

Octobien14_147

Octobien14_148

Octobien14_149

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Publication Info
Uploaded to GenBank?Yes
GenBank AccessionMH976515
Refseq NumberNone yet
Archiving Info
Archiving status Archived
SEA Lysate Titer 9.5x10^8
Pitt Freezer Box# 49
Pitt Freezer Box Grid# E5
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