Gordonia phage Sixama
Know something about this phage that we don't? Modify its data.
Detailed Information for Phage Sixama
Discovery Information
Isolation HostGordonia terrae NRRL B-16283
Found ByKonstantinos Koustas
Year Found2018
Location FoundDurham, NC USA
Finding InstitutionDurham Technical Community College
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?No
Isolation Temperature35°C
GPS Coordinates36.078306 N, 79.005 W Map
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedDec 20, 2018
Sequencing FacilityPittsburgh Bacteriophage Institute
Shotgun Sequencing MethodIllumina
Approximate Shotgun Coverage363
Genome length (bp)115454
Character of genome endsDirect Terminal Repeat
Direct Terminal Repeat Length1702 bp
GC Content52.7%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterDS
Subcluster--
Cluster Life CycleLytic
Other Cluster Members
Annotating InstitutionDurham Technical Community College
Annotation StatusIn GenBank
Number of Genes171
Number of tRNAs28
Number of tmRNAs0
Has been Phamerated?Yes
Gene List

Click to View

Sixama_1

Sixama_2

Sixama_3

Sixama_4

Sixama_5

Sixama_6

Sixama_7

Sixama_8

Sixama_9

Sixama_10

Sixama_11

Sixama_12

Sixama_13

Sixama_14

Sixama_15

Sixama_16

Sixama_17

Sixama_18

Sixama_19

Sixama_20

Sixama_21

Sixama_22

Sixama_23

Sixama_24

Sixama_25

Sixama_26

Sixama_27

Sixama_28

Sixama_29

Sixama_30
(helix-turn-helix DNA binding domain protein)

Sixama_31

Sixama_32

Sixama_33

Sixama_34

Sixama_35

Sixama_36

Sixama_37

Sixama_38

Sixama_39

Sixama_40

Sixama_41

Sixama_42

Sixama_43

Sixama_44

Sixama_45

Sixama_46

Sixama_47

Sixama_48

Sixama_49

Sixama_50

Sixama_51

Sixama_52

Sixama_53
(polynucleotide kinase)

Sixama_54

Sixama_55

Sixama_56
(ADP-ribosylglycohydrolase)

Sixama_57

Sixama_58

Sixama_59

Sixama_60

Sixama_61

Sixama_62
(terminase)

Sixama_63

Sixama_64

Sixama_65

Sixama_66
(HNH endonuclease)

Sixama_67
(WhiB family transcription factor)

Sixama_68
(MuF-like minor capsid protein)

Sixama_69
(G-I-Y Y-I-G endonuclease)

Sixama_70

Sixama_71

Sixama_72
(portal protein)

Sixama_73

Sixama_74

Sixama_75
(ADP-ribosyltransferase)

Sixama_76

Sixama_77

Sixama_78

Sixama_79

Sixama_80

Sixama_81
(major capsid hexamer protein)

Sixama_82

Sixama_83

Sixama_84
(head-to-tail adaptor)

Sixama_85

Sixama_86

Sixama_87

Sixama_88

Sixama_89
(tyrosine integrase)

Sixama_90

Sixama_91
(glycosyltransferase)

Sixama_92
(glycosyltransferase)

Sixama_93

Sixama_94

Sixama_95

Sixama_96

Sixama_97
(tape measure protein)

Sixama_98
(minor tail protein)

Sixama_99
(minor tail protein)

Sixama_100

Sixama_101

Sixama_102

Sixama_103

Sixama_104
(minor tail protein)

Sixama_105

Sixama_106
(lysin A, protease C39 domain)

Sixama_107
(lysin A, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain)

Sixama_108

Sixama_109

Sixama_110
(holin)

Sixama_111

Sixama_112

Sixama_113

Sixama_114

Sixama_115

Sixama_116

Sixama_117
(AAA-ATPase)

Sixama_118
(WhiB family transcription factor)

Sixama_119

Sixama_120
(methyltransferase)

Sixama_121

Sixama_122
(MazG-like nucleotide pyrophosphohydrolase)

Sixama_123

Sixama_124
(band-7-like membrane protein)

Sixama_125

Sixama_126
(glycosyltransferase)

Sixama_127

Sixama_128

Sixama_129 — tRNA
(tRNA-Phe(gaa))

Sixama_130 — tRNA
(tRNA-Arg(tct))

Sixama_131 — tRNA
(tRNA-Thr(tgt))

Sixama_132 — tRNA
(tRNA-Val(tac))

Sixama_133 — tRNA
(tRNA-Gly(tcc))

Sixama_134
(HNH endonuclease)

Sixama_135 — tRNA
(tRNA-Glu(ttc))

Sixama_136 — tRNA
(tRNA-Lys(ttt))

Sixama_137 — tRNA
(tRNA-Lys(ctt))

Sixama_138

Sixama_139 — tRNA
(tRNA-Cys(gca))

Sixama_140

Sixama_141 — tRNA
(tRNA-Ser(tga))

Sixama_143 — tRNA
(tRNA-His(gtg))

Sixama_144 — tRNA
(tRNA-Leu(caa))

Sixama_145 — tRNA
(tRNA-Gln(ttg))

Sixama_146

Sixama_147 — tRNA
(tRNA-Trp(cca))

Sixama_148 — tRNA
(tRNA-Leu(taa))

Sixama_149 — tRNA
(tRNA-Glu(ctc))

Sixama_150 — tRNA
(tRNA-Leu(tag))

Sixama_151
(HNH endonuclease)

Sixama_152 — tRNA
(tRNA-Asp(gtc))

Sixama_153 — tRNA
(tRNA-Ala(tgc))

Sixama_154 — tRNA
(tRNA-Tyr(gta))

Sixama_155 — tRNA
(tRNA-Pro(tgg))

Sixama_156 — tRNA
(tRNA-Ile(gat))

Sixama_157 — tRNA
(tRNA-Met(cat))

Sixama_158 — tRNA
(tRNA-Met(cat))

Sixama_159 — tRNA
(tRNA-Ile(tat))

Sixama_160 — tRNA
(tRNA-Gln(ctg))

Sixama_161 — tRNA
(tRNA-Arg(acg))

Sixama_162 — tRNA
(tRNA-Asn(gtt))

Sixama_163
(Ro-like RNA binding protein)

Sixama_164

Sixama_165
(RecA-like DNA recombinase)

Sixama_166
(Cas4 family exonuclease)

Sixama_167

Sixama_168
(DNA helicase)

Sixama_169

Sixama_170

Sixama_171

Sixama_172
(DNA polymerase I)

Sixama_173
(G-I-Y Y-I-G endonuclease)

Sixama_174

Sixama_175
(deoxycytidylate deaminase)

Sixama_176
(HNH endonuclease)

Sixama_177

Sixama_178

Sixama_179
(thymidylate synthase)

Sixama_180
(thymidylate kinase)

Sixama_181
(G-I-Y Y-I-G endonuclease)

Sixama_182

Sixama_183
(lysin B)

Sixama_184

Sixama_185

Sixama_186

Sixama_187
(LamD-like)

Sixama_188

Sixama_189

Sixama_190
(helix-turn-helix DNA binding domain protein)

Sixama_191

Sixama_192

Sixama_193
(DnaB-like dsDNA helicase)

Sixama_194
(DNA primase/polymerase)

Sixama_195

Sixama_196

Sixama_197

Sixama_198

Sixama_199

Sixama_200

Submitted Annotation in DNA Master FormatDownload
Submitted Minimal DNA Master FileDownload
Author ListDownload
Annotation Cover SheetDownload
Publication Info
Uploaded to GenBank?Yes
GenBank AccessionMN484601
Refseq NumberNone yet
Archiving Info
Archiving status Archived
Pitt Freezer Box# 79
Pitt Freezer Box Grid# B1
Available Files
Plaque PictureDownload
EM PictureDownload
GenBank File for PhameratorDownload