Arthrobacter phage Atuin
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Detailed Information for Phage Atuin
Discovery Information
Isolation HostArthrobacter globiformis B-2979
Found ByLilianna Rolands
Year Found2019
Location FoundRiver Falls, WI United States
Finding InstitutionUniversity of Wisconsin-River Falls
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?Yes
Isolation Temperature28°C
GPS Coordinates44.853056 N, 92.627778 W Map
Discovery NotesThe soil was collected from a small forested area behind Stratton Hall on the UW-River Falls campus. It was cloudy, a little chilly, and had been raining.The soil was damp and packed.
Naming NotesNamed after the world-carrying space turtle in the Discworld books by Sir Terry Pratchett.
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedJan 27, 2020
Sequencing FacilityPittsburgh Bacteriophage Institute
Shotgun Sequencing MethodIllumina Sequencing
Approximate Shotgun Coverage575
Genome length (bp)194200
Character of genome endsDirect Terminal Repeat
Direct Terminal Repeat Length17312 bp
End Determination NotesAt first, we thought Cluster FC phages had no defined ends and were circularly permuted, but as we sequenced more, it became clear that the genomes had a region of double coverage, which is characteristic of a direct terminal repeat. As with some other phages, the right end of the terminal repeat is well-defined, while the left end is less clear.
GC Content54.2%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterFC
Subcluster--
Cluster Life CycleLytic
Other Cluster Members
Annotating InstitutionUniversity of Wisconsin-River Falls
Annotation StatusIn GenBank
Plaque NotesPlaques are small pinpoints, about 1mm in diameter, and are round, and clear. They have no halo and are uniform.
MorphotypeSiphoviridae
Number of Genes316
Number of tRNAs30
Number of tmRNAs0
Has been Phamerated?Yes
Gene List

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