Streptomyces phage Ejemplo
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Detailed Information for Phage Ejemplo
Discovery Information
Isolation HostStreptomyces griseus ATCC 10137
Found ByLee Hughes
Year Found2020
Location FoundDenton, TX USA
Finding InstitutionUniversity of North Texas
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?Yes
Isolation Temperature30°C
GPS Coordinates33.179738 N, 97.052192 W Map
Discovery NotesCollected soil from southeastern Denton, Texas. The temperature was about 85 degrees F and it was extremely humid from rain earlier in the morning. The location is on the edge of a lawn near some willow trees.
Naming NotesI isolated this phage to use as an example of how to isolate phages while videoing each step. I chose "Ejemplo" because it means "example" in Spanish.
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedJan 28, 2022
Sequencing FacilityUniversity of North Texas
Shotgun Sequencing MethodIllumina Sequencing
Approximate Shotgun Coverage151
Genome length (bp)51517
Character of genome ends3' Sticky Overhang
Overhang Length11 bases
Overhang SequenceCGGCCAGTGAT
GC Content65.7%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterBD
SubclusterBD1
Cluster Life CycleTemperate
Other Cluster Members

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Aaronocolus (BD1)

Asten (BD1)

BarryBee (BD1)

BeardedLady (BD1)

Bovely (BD1)

Brataylor (BD1)

BryanRecycles (BD1)

Caliburn (BD1)

Celeste (BD1)

Chucky (BD1)

Danzina (BD1)

Dattran (BD1)

Dwayne (BD1)

Eddasa (BD1)

Ejemplo (BD1)

Emaanora (BD1)

EnochSoames (BD1)

Esperer (BD1)

Goby (BD1)

Godpower (BD1)

Hippo (BD1)

Hydra (BD1)

Indigo (BD1)

Izzy (BD1)

Jash (BD1)

Katalie (BD1)

Lannister (BD1)

Legacy (BD1)

Leviticus (BD1)

Lika (BD1)

Lorelei (BD1)

Maneekul (BD1)

Nabi (BD1)

Nanodon (BD1)

Nerdos (BD1)

Oliynyk (BD1)

Ozzie (BD1)

OzzyJ (BD1)

Phettuccine (BD1)

Rana (BD1)

RedBear (BD1)

Rusticus (BD1)

SarahRose (BD1)

Snorlax (BD1)

South40 (BD1)

Sujidade (BD1)

SunsetPointe (BD1)

TagePhighter (BD1)

Toma (BD1)

Triste (BD1)

TuanPN (BD1)

Unstoppable (BD1)

Werner (BD1)

Whatever (BD1)

Yasdnil (BD1)

Zemlya (BD1)

Alvy (BD2)

Amethyst (BD2)

Andris (BD2)

Animus (BD2)

BartholomewSD (BD2)

Bowden (BD2)

Caelum (BD2)

Daudau (BD2)

Diane (BD2)

ELB20 (BD2)

GirlDinner (BD2)

Haizum (BD2)

Hank144 (BD2)

Issmi (BD2)

Janus (BD2)

Jevington (BD2)

Loofah (BD2)

Marav (BD2)

Nishikigoi (BD2)

Omar (BD2)

Pablito (BD2)

Paedore (BD2)

Paolo (BD2)

Puginator (BD2)

R4 (BD2)

SqueakyClean (BD2)

Superstar (BD2)

Tefunt (BD2)

Thestral (BD2)

TinaBelcher (BD2)

Triumph (BD2)

TrvxScott (BD2)

Zainub (BD2)

Alsaber (BD3)

Amela (BD3)

Celery (BD3)

Conan (BD3)

Dexers (BD3)

ElGato (BD3)

Kaine (BD3)

Pavo (BD3)

phiCAM (BD3)

Provolone (BD3)

Saftant (BD3)

Speedwell (BD3)

Vanseggelen (BD3)

Verabelle (BD3)

Verse (BD3)

Yosif (BD3)

BroPlease (BD4)

GreenWeasel (BD4)

phiHau3 (BD4)

StrepC (BD5)

Celia (BD6)

Itza (BD6)

Urza (BD6)

VieEnRose (BD6)

Annotating InstitutionUniversity of North Texas
Annotation StatusIn GenBank
Plaque NotesMostly clear plaques. Most are about 1mm in diameter, but there are often smaller plaques mixed in on the titer plates (these small plaques give both sizes of plaques when used to infect a culture).
Number of Genes71
Number of tRNAs0
Number of tmRNAs0
Has been Phamerated?Yes
Gene List

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Ejemplo_1

Ejemplo_2
(HNH endonuclease)

Ejemplo_3

Ejemplo_4
(thioredoxin)

Ejemplo_5
(terminase small subunit)

Ejemplo_6
(terminase large subunit)

Ejemplo_7
(portal protein)

Ejemplo_8

Ejemplo_9
(scaffolding protein)

Ejemplo_10
(major capsid protein)

Ejemplo_11
(head-to-tail adaptor)

Ejemplo_12
(head-to-tail stopper)

Ejemplo_13

Ejemplo_14
(tail terminator)

Ejemplo_15
(major tail protein)

Ejemplo_16
(tail assembly chaperone)

Ejemplo_17
(tail assembly chaperone)

Ejemplo_18
(tape measure protein)

Ejemplo_19
(minor tail protein)

Ejemplo_20
(minor tail protein)

Ejemplo_21

Ejemplo_22

Ejemplo_23
(minor tail protein)

Ejemplo_24

Ejemplo_25
(endolysin)

Ejemplo_26

Ejemplo_27
(DNA binding protein)

Ejemplo_28
(immunity repressor)

Ejemplo_29

Ejemplo_30
(exonuclease)

Ejemplo_31

Ejemplo_32

Ejemplo_33
(deoxycytidylate deaminase)

Ejemplo_34
(DnaB-like dsDNA helicase)

Ejemplo_35
(holliday junction resolvase)

Ejemplo_36

Ejemplo_37
(DNA primase)

Ejemplo_38
(DNA primase)

Ejemplo_39

Ejemplo_40

Ejemplo_41

Ejemplo_42
(exonuclease)

Ejemplo_43

Ejemplo_44
(DNA binding protein)

Ejemplo_45

Ejemplo_46
(ribonucleotide reductase)

Ejemplo_47
(DNA methyltransferase)

Ejemplo_48

Ejemplo_49
(serine integrase)

Ejemplo_50
(ThyX-like thymidylate synthase)

Ejemplo_51

Ejemplo_52
(DnaE-like DNA polymerase III alpha)

Ejemplo_53

Ejemplo_54

Ejemplo_55

Ejemplo_56
(deoxynucleoside monophosphate kinase)

Ejemplo_57

Ejemplo_58

Ejemplo_59

Ejemplo_60

Ejemplo_61

Ejemplo_62

Ejemplo_63
(HNH endonuclease)

Ejemplo_64

Ejemplo_65

Ejemplo_66

Ejemplo_67

Ejemplo_68

Ejemplo_69

Ejemplo_70

Ejemplo_71
(acetyltransferase)

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Publication Info
Uploaded to GenBank?Yes
GenBank AccessionON526985
Refseq NumberNone yet
Archiving Info
Archiving status Archived
Pitt Freezer Box# 117
Pitt Freezer Box Grid# F10
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