Mycobacterium phage NelitzaMV
Know something about this phage that we don't? Modify its data.
Detailed Information for Phage NelitzaMV
Discovery Information
Isolation HostMycobacterium smegmatis mc²155
Found ByYanilda Martinez Vega
Year Found2011
Location FoundRichmond, VA USA
Finding InstitutionVirginia Commonwealth University
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?Yes
Isolation TemperatureNot entered
GPS Coordinates37.625814 N, 77.554336 W Map
Discovery NotesSoil sample was taken from an apartment complex garden, under a tree. Temperature: 74ºF. Depth: 0-5cm, moist soil. Time: 7:15am, 09/21/2011.
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedApr 18, 2012
Sequencing FacilityVirginia Commonwealth University Nucleic Acids Research Facilities
Shotgun Sequencing Method454 Pyrosequencing
Genome length (bp)72790
Character of genome ends3' Sticky Overhang
Overhang Length9 bases
Overhang SequenceCGCTTGTCA
GC Content63.1%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterE
Subcluster--
Other Cluster Members
Plaque NotesVaried plaque morphology. Smaller plaques (1mm) are clear. Larger plaques (3mm) are clear in the center with a halo.
MorphotypeSiphoviridae
Final annotation complete?Yes
Number of Genes139
Number of tRNAs2
Has been Phamerated?Yes
Gene List

Click to View

NelitzaMV_1

NelitzaMV_2

NelitzaMV_3

NelitzaMV_4

NelitzaMV_5

NelitzaMV_6
(Terminase small subunit)

NelitzaMV_7

NelitzaMV_8

NelitzaMV_9
(Terminase large subunit)

NelitzaMV_10

NelitzaMV_11
(Portal)

NelitzaMV_12
(Capsid maturation protease)

NelitzaMV_13
(Major capsid)

NelitzaMV_14

NelitzaMV_15
(Head-tail connector)

NelitzaMV_16
(Head-tail connector)

NelitzaMV_17
(Head-tail connector)

NelitzaMV_18

NelitzaMV_19
(Major tail subunit)

NelitzaMV_20
(Tail assembly chaperone)

NelitzaMV_21
(Tail assembly chaperone)

NelitzaMV_22
(Tapemeasure)

NelitzaMV_23
(Minor tail)

NelitzaMV_24
(Minor tail)

NelitzaMV_25
(Minor tail)

NelitzaMV_26
(Minor tail)

NelitzaMV_27
(D-Ala-D-Ala carboxypeptidase)

NelitzaMV_28

NelitzaMV_29

NelitzaMV_30
(HTH DNA binding)

NelitzaMV_31

NelitzaMV_32
(Lysin A)

NelitzaMV_33
(Holin)

NelitzaMV_34

NelitzaMV_35
(Lysin B)

NelitzaMV_36

NelitzaMV_37
(NrdH-redoxin (NrdH))

NelitzaMV_38
(Lrs2)

NelitzaMV_39

NelitzaMV_40

NelitzaMV_41

NelitzaMV_42

NelitzaMV_43

NelitzaMV_44

NelitzaMV_45

NelitzaMV_46

NelitzaMV_47

NelitzaMV_48

NelitzaMV_49
(Integrase (Y-int))

NelitzaMV_50

NelitzaMV_51

NelitzaMV_52

NelitzaMV_53

NelitzaMV_54

NelitzaMV_55
(Pentapeptide repeat)

NelitzaMV_56

NelitzaMV_57

NelitzaMV_58

NelitzaMV_59

NelitzaMV_60

NelitzaMV_61

NelitzaMV_62

NelitzaMV_63

NelitzaMV_64

NelitzaMV_65

NelitzaMV_66

NelitzaMV_67
(ERF-like)

NelitzaMV_68

NelitzaMV_69

NelitzaMV_70

NelitzaMV_71

NelitzaMV_72

NelitzaMV_73

NelitzaMV_74

NelitzaMV_75
(HNH endonuclease)

NelitzaMV_76

NelitzaMV_77

NelitzaMV_78

NelitzaMV_79
(DNAB helicase)

NelitzaMV_80

NelitzaMV_81

NelitzaMV_82

NelitzaMV_83

NelitzaMV_84
(Holliday junction resolvase)

NelitzaMV_85

NelitzaMV_86
(Polynucleotide kinase.)

NelitzaMV_87

NelitzaMV_88

NelitzaMV_89
(RNA ligase)

NelitzaMV_90
(HTH DNA binding)

NelitzaMV_91
(WhiB)

NelitzaMV_92

NelitzaMV_93

NelitzaMV_94

NelitzaMV_95

NelitzaMV_96

NelitzaMV_97
(ssDNA binding)

NelitzaMV_98
(Clp protease)

NelitzaMV_99

NelitzaMV_100

NelitzaMV_101

NelitzaMV_102
(HTH DNA binding)

NelitzaMV_103
(HNH homing endonuclease)

NelitzaMV_106

NelitzaMV_107

NelitzaMV_108

NelitzaMV_109

NelitzaMV_110
(DNA polymerase)

NelitzaMV_111

NelitzaMV_112

NelitzaMV_113

NelitzaMV_114

NelitzaMV_115

NelitzaMV_116

NelitzaMV_117

NelitzaMV_118

NelitzaMV_119

NelitzaMV_120

NelitzaMV_121

NelitzaMV_122

NelitzaMV_123

NelitzaMV_124

NelitzaMV_125
(HTH DNA binding)

NelitzaMV_126

NelitzaMV_127

NelitzaMV_128

NelitzaMV_129

NelitzaMV_130

NelitzaMV_131

NelitzaMV_132

NelitzaMV_133

NelitzaMV_134

NelitzaMV_135

NelitzaMV_136

NelitzaMV_137

NelitzaMV_138

NelitzaMV_139

NelitzaMV_140

NelitzaMV_141

Submitted Annotation in DNA Master FormatDownload
Author ListDownload
Annotation Cover SheetDownload
Publication Info
Uploaded to GenBank?Yes
GenBank AccessionKT222941
Refseq NumberNone yet
Published in PaperPope, Bowman, Russell, et al 2015, eLIFE
Available Files
Plaque PictureDownload
EM PictureDownload