Mycobacterium phage NuevoMundo
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Detailed Information for Phage NuevoMundo
Discovery Information
Isolation HostMycobacterium smegmatis mc²155
Found ByIzamar Flores Castillo
Year Found2011
Location FoundDenton, TX USA
Finding InstitutionUniversity of North Texas
ProgramScience Education Alliance-Phage Hunters Advancing Genomics and Evolutionary Science
From enriched soil sample?Yes
Isolation TemperatureNot entered
GPS Coordinates33.146508 N, 97.102889 W Map
Discovery NotesAcquired 1 to 2 inches below ground. Soil was dark and kind of moist. It was acquired at 7:30 in the morning. The temperature was around 31.67° Celsius.
Sequencing Information
Sequencing Complete?Yes
Date Sequencing CompletedFeb 9, 2012
Sequencing FacilityDavid H. Murdock Research Institute
Shotgun Sequencing Method454
Approximate Shotgun Coverage227
Genome length (bp)155943
Character of genome endsCircularly Permuted
GC Content64.7%
Fasta file available?Yes: Download fasta file
Characterization
ClusterC
SubclusterC1
Cluster Life CycleLytic
Other Cluster Members

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Ading (C1)

Adlitam (C1)

Alice (C1)

Amataga (C1)

ArcherS7 (C1)

Asterius (C1)

Astraea (C1)

Atlantean (C1)

Audrick (C1)

Ava3 (C1)

Babyland (C1)

BackyardAgain (C1)

BadAgartude (C1)

BananaFence (C1)

Bangla1971 (C1)

Basquiat (C1)

BeanWater (C1)

BigCity (C1)

Bigswole (C1)

Bipolarisk (C1)

Blackbrain (C1)

Blackdragon (C1)

Blubba (C1)

Bonray (C1)

Bread (C1)

Breeniome (C1)

Burrough (C1)

Bxz1 (C1)

Cactojaque (C1)

Cali (C1)

Cane17 (C1)

Capablanca (C1)

Caravan (C1)

Catera (C1)

Chargie21 (C1)

CharlieB (C1)

ChaylaJr (C1)

ChickenPhender (C1)

Chomp (C1)

CindyLou (C1)

Colt (C1)

Concombre (C1)

Daffodil (C1)

Dandelion (C1)

Darko (C1)

Delilah (C1)

Delylah (C1)

Demodog (C1)

Derek (C1)

Dietrick (C1)

DirtMonster (C1)

Domi (C1)

Drazdys (C1)

DrPhinkDaddy (C1)

DTDevon (C1)

EasyJones (C1)

EggyFarm (C1)

EmmaElysia (C1)

EmToTheThree (C1)

Erdmann (C1)

ErnieJ (C1)

Essence (C1)

ET08 (C1)

Ewok (C1)

Flabslab (C1)

Fludd (C1)

FoxtrotP1 (C1)

FrayBell (C1)

FudgeTart (C1)

Gabriel (C1)

Gamgam (C1)

Ghost (C1)

Gizmo (C1)

Grasshills (C1)

Grungle (C1)

Guwapp (C1)

Halldule (C1)

HyRo (C1)

I3 (C1)

IkeLoa (C1)

InigoMontoya (C1)

InterFolia (C1)

Iota (C1)

Issimir (C1)

Izajani (C1)

Janiyra (C1)

Jaygup (C1)

JayJay (C1)

Jedediah (C1)

Jemmno (C1)

Jessibeth14 (C1)

JigglyPuff (C1)

JPickles (C1)

JulietS (C1)

JustHall (C1)

Kamryn (C1)

Kboogie (C1)

Khaleesi (C1)

Koguma (C1)

Latch (C1)

Lee7 (C1)

Lethe (C1)

LifeSavor (C1)

LinStu (C1)

Littleton (C1)

Loanshark (C1)

LolaVinca (C1)

LordLeafolot (C1)

LRRHood (C1)

Lukilu (C1)

Maby2021 (C1)

Mangeria (C1)

Matsumoto (C1)

McGee (C1)

McWolfish (C1)

Megamind (C1)

Melpomini (C1)

MikeLiesIn (C1)

Mikro (C1)

Momo (C1)

MoMoMixon (C1)

Morizzled23 (C1)

Naija (C1)

Napoleon13 (C1)

Nappy (C1)

Naval22 (C1)

NedWong (C1)

Ngannou (C1)

Nidhogg (C1)

NoodleTree (C1)

Norm (C1)

NuevoMundo (C1)

ParkTD (C1)

Patter (C1)

Phlegm (C1)

Phox (C1)

Phusco (C1)

Pier (C1)

Pinkcreek (C1)

Pio (C1)

Pivoine (C1)

Pleione (C1)

PurduePete (C1)

QBert (C1)

Quasimodo (C1)

Rabinovish (C1)

Rahel (C1)

Rizal (C1)

RoMag (C1)

Ronan (C1)

Roots515 (C1)

Salacia (C1)

Sauce (C1)

ScottMcG (C1)

Sebata (C1)

Shaqnato (C1)

Shelob (C1)

ShiaLabeouf (C1)

Shifa (C1)

Shnickers (C1)

Shrimp (C1)

SilverDipper (C1)

SmallFry (C1)

Spec (C1)

Specks (C1)

Sprinklers (C1)

Spud (C1)

SrishMeg2525 (C1)

StephanieG (C1)

Stubby (C1)

StubbySaigey (C1)

Tainan (C1)

Teardrop (C1)

TinyTim (C1)

Tonenili (C1)

Tortoise16 (C1)

Trinitium (C1)

Turret (C1)

Tyke (C1)

ValleyTerrace (C1)

Wally (C1)

Willis (C1)

Yassified (C1)

YemiJoy2021 (C1)

YoungMoneyMata (C1)

Yucca (C1)

Zalkecks (C1)

Zeenon (C1)

ZygoTaiga (C1)

Greely (C2)

Myrna (C2)

Phabba (C2)

ScoobyDoobyDoo (C2)

Annotating InstitutionUnknown or unassigned
Annotation StatusIn GenBank
Plaque NotesThe size is fairly small, with a constant size of around .5 millimeters. The plaque is clear.
MorphotypeMyoviridae
Number of Genes236
Number of tRNAs32
Number of tmRNAs1
Has been Phamerated?Yes
Gene List

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NuevoMundo_1

NuevoMundo_2

NuevoMundo_3
(nucleotidyltransferase)

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NuevoMundo_7

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(band-7-like membrane protein)

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(helix-turn-helix DNA binding domain protein)

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NuevoMundo_88

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NuevoMundo_90 — tRNA
(tRNA-Ser(gct))

NuevoMundo_91 — tRNA
(tRNA-Leu(cag))

NuevoMundo_92 — tRNA
(tRNA-Leu(gag))

NuevoMundo_93 — tRNA
(tRNA-Leu(caa))

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(portal protein)

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(ThyX-like thymidylate synthase)

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(major capsid protein)

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NuevoMundo_121

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NuevoMundo_123

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NuevoMundo_129

NuevoMundo_130

NuevoMundo_131

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(tail sheath protein)

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NuevoMundo_135
(tail assembly chaperone)

NuevoMundo_136

NuevoMundo_137
(tape measure protein)

NuevoMundo_138

NuevoMundo_139

NuevoMundo_140

NuevoMundo_141
(minor tail protein)

NuevoMundo_142

NuevoMundo_143

NuevoMundo_144

NuevoMundo_145
(baseplate J protein)

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NuevoMundo_148

NuevoMundo_149

NuevoMundo_150
(minor tail protein)

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NuevoMundo_152

NuevoMundo_153

NuevoMundo_154

NuevoMundo_155

NuevoMundo_156

NuevoMundo_157

NuevoMundo_158 — tRNA
(tRNA-Pro(tgg))

NuevoMundo_159 — tRNA
(tRNA-Trp(cca))

NuevoMundo_160 — tRNA
(tRNA-Tyr(gta))

NuevoMundo_161

NuevoMundo_162

NuevoMundo_163
(peptidyl tRNA hydrolase)

NuevoMundo_164 — tRNA
(tRNA-other(cta)

NuevoMundo_165 — tRNA
(tRNA-Met(cat))

NuevoMundo_166 — tRNA
(tRNA-Cys(gca))

NuevoMundo_167 — tRNA
(tRNA-Glu(ctc))

NuevoMundo_168 — tRNA
(tRNA-His(gtg))

NuevoMundo_169 — tRNA
(tRNA-Ala(tgc))

NuevoMundo_170 — tRNA
(tRNA-Phe(gaa))

NuevoMundo_171 — tRNA
(tRNA-Val(cac))

NuevoMundo_172 — tRNA
(tRNA-Lys(ctt))

NuevoMundo_173 — tRNA
(tRNA-Glu(ttc))

NuevoMundo_174 — tRNA
(tRNA-Gly(tcc))

NuevoMundo_175 — tRNA
(tRNA-Thr(cgt))

NuevoMundo_176 — tRNA
(tRNA-Thr(tgt))

NuevoMundo_177 — tRNA
(tRNA-Thr(ggt))

NuevoMundo_178
(minor tail protein)

NuevoMundo_179

NuevoMundo_180 — tRNA
(tRNA-Gly(gcc))

NuevoMundo_181 — tRNA
(tRNA-Asp(gtc))

NuevoMundo_182 — tRNA
(tRNA-Met(cat))

NuevoMundo_183 — tRNA
(tRNA-Ile(gat))

NuevoMundo_184 — tRNA
(tRNA-Arg(acg))

NuevoMundo_185 — tRNA
(tRNA-Val(gac))

NuevoMundo_186 — tRNA
(tRNA-Arg(cct))

NuevoMundo_187 — tmRNA

NuevoMundo_188 — tRNA
(tRNA-Gln(ttg))

NuevoMundo_189 — tRNA
(tRNA-Arg(tct))

NuevoMundo_190

NuevoMundo_191
(DNA helicase)

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NuevoMundo_200

NuevoMundo_201
(aminotransferase)

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NuevoMundo_203

NuevoMundo_204

NuevoMundo_205
(DnaC-like helicase loader)

NuevoMundo_206
(DnaB-like dsDNA helicase)

NuevoMundo_207

NuevoMundo_208
(DNA primase)

NuevoMundo_209

NuevoMundo_210
(DnaJ-like chaperonin)

NuevoMundo_211

NuevoMundo_212
(DnaE-like DNA polymerase III)

NuevoMundo_213
(RF-1 peptide chain release factor)

NuevoMundo_214
(RecA-like DNA recombinase)

NuevoMundo_215

NuevoMundo_216

NuevoMundo_217

NuevoMundo_218
(RusA-like resolvase)

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NuevoMundo_221

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NuevoMundo_223

NuevoMundo_224

NuevoMundo_225

NuevoMundo_226 — tRNA
(tRNA-Gln(ctg))

NuevoMundo_227 — tRNA
(tRNA-Asn(gtt))

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NuevoMundo_229

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NuevoMundo_231

NuevoMundo_232

NuevoMundo_233

NuevoMundo_234
(Ro-like RNA binding protein)

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NuevoMundo_238

NuevoMundo_239

NuevoMundo_240

NuevoMundo_241

NuevoMundo_242
(glycosyltransferase)

NuevoMundo_243

NuevoMundo_244
(glycosyltransferase)

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(PnuC-like nicotinamide riboside transporter)

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NuevoMundo_250

NuevoMundo_251

NuevoMundo_252
(lysin A)

NuevoMundo_253
(holin)

NuevoMundo_254
(lysin B)

NuevoMundo_255
(terminase)

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NuevoMundo_257

NuevoMundo_258

NuevoMundo_259

NuevoMundo_260
(polynucleotide kinase)

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NuevoMundo_262

NuevoMundo_263
(serine/threonine kinase)

NuevoMundo_264

NuevoMundo_265

NuevoMundo_266
(PurA-like adenylosuccinate synthetase)

NuevoMundo_267

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NuevoMundo_269

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Publication Info
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GenBank AccessionMG812493
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Published in PaperPope, Bowman, Russell, et al 2015, eLIFE: Whole genome comparison of a large collection of mycobacteriophages reveals a continuum of phage genetic diversity
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SEA Designator 2011UNTDnuevomundoIFC
Pitt Freezer Box# 29
Pitt Freezer Box Grid# 20
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